根据次生代谢产物激活的可预测性和不可预测性,我们将目前的激活策略分为非定向的沉默基因簇激活策略和定向的沉默基因簇激活策略(见图 1):非定向激活策略包括基于培养基成分改变或培养条件优化的激活策略、基于微生物共培养的激活策略、基于表观...
以下是沉默基因簇的一些主要特点: 1. 低表达或不表达:沉默基因簇最显著的特点是它们在细胞中的转录水平非常低或几乎不被检测到。这可能是由于缺乏必要的转录因子结合位点,或者是因为表观遗传修饰导致基因的沉默。 2. 表观遗传调控:沉默基因簇常常受到DNA甲基化和组蛋白修饰等表观遗传机制的影响。这些化学修饰可以...
CRISPR/Cas9系统常被用于基因敲除激活沉默基因簇操作。基因敲除激活沉默基因簇可用于探索疾病相关沉默基因的作用。研究人员会先确定目标沉默基因簇在染色体上的具体位置。构建合适的基因载体是基因敲除激活沉默基因簇的重要环节。基因敲除激活沉默基因簇实验需严格控制实验条件。 沉默基因簇激活后可能带来细胞功能的显著改变。
研究发现AsvosA过表达可特异性激活紫色色素合成关键基因EVM0012129.1,为真菌沉默基因簇激活及天然产物开发提供了新策略。 在真菌王国中,数以万计的生物合成基因簇(Biosynthetic Gene Clusters, BGCs)如同沉睡的宝藏,其中蕴藏着生产抗生素、抗癌药物等重要化合物的密码。然而令人遗憾的是,这些基因簇在标准实验室条件下往往保...
沉默基因簇挖掘与微生物菌株育种 菌种选育杂交育种 01:11:29
前期研究发现,真菌次级代谢产物的产生与特定环境因素密切相关,受到复杂的基因调控,发生在多个水平。其中负责真菌次级代谢调控的蛋白,统称为“调控因子”。通过分子遗传操纵调控因子来激活真菌沉默基因簇是课题组研究方向之一。近年来,研究组已成功将该技术应用到多株真菌的沉默基因簇激活,并获得新颖化合物近50个。例如: ...
前期研究发现,真菌次级代谢产物的产生与特定环境因素密切相关,受到复杂的基因调控,发生在多个水平。其中负责真菌次级代谢调控的蛋白,统称为“调控因子”。通过分子遗传操纵调控因子来激活真菌沉默基因簇是课题组研究方向之一。近年来,研究组已成功将该技术应用到多株真菌的沉默基因簇激活,并获得新颖化合物近50个。例如: ...
随着微生物基因组测序项目开展,越来越多的沉默基因簇被发现。采用激活微生物沉默基因簇的方法,可以充分发掘 微生物次级代谢的潜力并可以获得大量新结构天然产物,为新药发现提供更多天然化合物来源。本文简要介绍激活沉默基因 簇合成微生物次级代谢产物的方法。 关键词: 激活;沉默;生物合成基因簇;代谢产物 )( 501 )( ...
沉默基因簇是指在常规培养条件下未表达 或表达量很低的基因簇。随着DNA 测序技术的突飞猛进，越来越多的微生物全基因组被测出来，利用生物信息学分析这些基因组数据，发现了基因组中存在许多的沉默基因簇。微生物中存在的沉默基因簇远比它目前已报道发现的次级代谢产物要多得多，如根据报道目前天蓝色链霉菌中发现的...
沉默基因簇的问题具有挑战性,因为未知信号会激活未表征的基因簇,从而导致新代谢物的产生在这个过程中有三个变量,其中两个变量可以通过实验或计算确定:生物信息学方法可以方便地鉴定产生非核糖体肽、聚酮和萜烯类的基因,并且很好地保真地确定这些家族中的新代谢物的基因组合。该基因簇一旦被激活,就可以通过差异代谢组学...