作为一种研究蛋白质与DNA相互作用的技术，ChIP可以完整真实地反映细胞中特定蛋白与DNA的结合关系，它通过多种蛋白质组学和分子生物学方法，包括交联、细胞裂解（蛋白质-DNA提取）、核酸剪切、抗体免疫沉淀、DNA样本回收，将蛋白-DNA复合物分离出来进一步研究特定的结合蛋白或与其结合的DNA，同时结合qPCR（ChIP-qPCR）可用...
染色质免疫沉淀分析(ChiP)是基于体内分析发展起来的方法,它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并通过超声或酶处理将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过抗原抗体的特异性识别反应沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用...
由于芯片信号识别过程中弱信号常常会被丢弃而强信号会饱和,因此通过ChIP-chip获得的信号强度往往不是线性的,其信号强度的量程限定在一定范围内,而ChIP-seq有效地避免了这种情况。Alekseyenko等在相同的实验条件下比较了ChIP-seq和ChIP-chip数据识别能力,发现ChIP-seq中出现的一些明显的且具有生物学意义的峰(Peaks)常常在...
染色质免疫沉淀法（Chromatin immunoprecipitation，ChIP）是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况，还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。主要应用 核小体组蛋白可以发生多种翻译后的共价修饰，如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等，这些共价修饰与真核基因的表达密切...
染色质免疫共沉淀-芯片/序列分析技术,是指染色质免疫共沉淀与 DNA 芯片以及二代测序结合的技术。 原理 染色质免疫共沉淀-芯片/序列分析技术的基本原理是利用染色质免疫共沉淀获取 DNA 片段然后通过 DNA 芯片或者二代测序技术对 DNA 片段进行鉴定。 用途
染色质免疫沉淀(ChIP)实验通过组蛋白修饰(表观遗传学)或转录因子-DNA 结合相互作用,监测转录调控,识别基因组和蛋白质组之间的联系。ChIP 实验的优势在于能够捕捉系统中特定蛋白质-DNA 相互作用,并使用定量聚合酶链反应(qPCR)对相互作用进行量化。染色质免...
染色质免疫共沉淀(ChIP) 染色质免疫共沉淀可以:(1)组蛋白修饰酶的抗体作为“生物标记”;(2)转录调控分析;(3)药物开发研究;(4)DNA损失与凋亡分析。 1实验方法原理: 在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。
一、ChIP实验原理 染色质免疫共沉淀(Chromatinimmunoprecipitation,ChIP)技术是目前公认的研究蛋白质与DNA 相互作用的最佳选择。 基本原理是在活细胞状态下获得自然状态下蛋白质、DNA结合复合物,通过试剂交联固定蛋白DNA复合物,破碎细胞后获得细胞核DNA片段,利用超声波方法将核DNA随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后...
ChIP实验中与一般的抗原-抗体免疫反应实验不太一样。 常规实验如western blot、蛋白质免疫共沉淀等,抗原上只要存在与抗体结合的位点,则二者的免疫反应基本不受到蛋白质空间结构影响。 ChIP实验中,染色质沉淀步骤时,蛋白和DNA处在交联状态,目标蛋白的结合位点形成空间阻...