Hi-C最初是一种低分辨率、高噪声技术,构建100Mb大小的Hi-C库需要几天的时间,另外数据的输出和再现性都很低。然而,Hi-C数据为染色质构象以及基因组结构提供了新的见解,这些应用前景促使科学家在过去十年中持续努力改进这项技术。 在2012年至2015年期间,Hi-C方案进行了几次修改,如采用4-cutter分解或采用更深的...
Hi-C技术是三维基因组学的主要研究方法,新的DLO Hi-C染色体构象捕获技术,采用同时酶切酶连的方式,将DNA接头连接在染色体内切酶切口末端上,然后进行邻近酶连,最后将用MmeI内切酶酶切消化,回收固定大小互作DNA片段,从而大大地降低了背景数据...
【Record 】Hi-C技术源于染色体构象捕获 (Chromosome conformation capture, 3C)技术,以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,通过对染色质内全部DNA相互作用模式进行捕获,获得高分辨率的染色质三维结构信息。2009年,Job Dekker研究团队首次...
基因组三维结构在DNA复制,DNA损伤修复,基因转录调控中扮演着重要的角色.Hi-C是目前研究基因组三维结构的主要手段之一,但是存在背景噪音大,试验成本高,试验流程繁琐,缺乏对随机连接噪音的评价等缺陷,因而限制了三维基因组学的发展.为此,我们开发了一种简单经济的染色体构象捕获技术,即DLO Hi-C(digestion-ligation-only ...