无标记定量蛋白质组学 无标记定量蛋白质组学是一种不使用稳定同位素标记的蛋白质组学方法,而是通过比较两种或多种样品中的蛋白质含量来确定其相对丰度。该技术常用的方法包括多反应监测法(MRM)、蛋白质谱图匹配法(Spectral Counting)和全蛋白质谱法(全MS)。与有标记方法相比,无标记定量方法具有操作简便、成本低、...
无标记定量蛋白质组学技术主要基于质谱分析原理。首先,样品中的蛋白质会经过消化酶的作用,将蛋白质分解成肽段。然后,这些肽段会通过液相色谱分离,并进入质谱仪进行分析。质谱仪会将肽段进行离子化,并根据其质荷比进行分离和检测。最后,通过比较样品中不同肽段的峰面积或峰高度,可以推断出蛋白质的相对丰度。六...
1.蛋白质提取: 从样品中提取蛋白质。 2.蛋白质消化: 使用酶(如胰蛋白酶)将蛋白质消化成肽段。 3.液相色谱-质谱(LC-MS/MS)分析: 使用MRM或SRM方法采集质谱数据。 4.数据分析: 使用特定的软件(如Skyline)对MRM或SRM数据进行分析和定量。 六、优点和挑战 1.优点: (1)无需标记:避免了标记步骤,减少了实验...
无标记定量蛋白质组学是一种高通量技术,用于测量样本中的蛋白质在不同生物条件下的表达水平,而无需依赖特定的标记试剂。这使得无标记定量蛋白质组学成为研究生物过程的理想选择,因为它可以广泛应用于各种生物样本。2. 质谱在无标记定量蛋白质组学中的应用 质谱技术是无标记定量蛋白质组学的核心。其中,液相色谱质...
无标记定量蛋白质组学技术是一种基于质谱的方法,用于测量样品中蛋白质的相对丰度。与传统的标记技术相比,label free技术不需要事先对蛋白质样品进行化学标记,因此更加简便和灵活。 在label free技术中,样品中的蛋白质首先通过消化酶进行降解,生成一系列的肽段。然后,这些肽段通过质谱仪进行分析,得到它们的质量-荷质比...
无标记定量蛋白质组学技术是一种基于质谱的方法,用于测量样品中蛋白质的相对丰度。与传统的标记技术相比,label free技术不需要事先对蛋白质样品进行化学标记,因此更加简便和灵活。 在label free技术中,样品中的蛋白质首先通过消化酶进行降解,生成一系列的肽段。然后,这些肽段通过质谱仪进行分析,得到它们的质量-荷质比...
1. DXWR无标记定量蛋白质组学分析 通过MS分析获得的肽评分,结果显示约78.22%的肽得分在60以上,这表明LC-MS/MS实验数据的质量相对较高(附图S1)。通过无标记蛋白质组学数据分析,从6个DXWR根样品(分别为RLP和RCK,分别有3个生物学...
蛋白质组学研究中的无标记定量方法 蛋白质定量是探索疾病发生发展状况和寻找新药靶标的重要手段.该领域最常用的技术是比较染色后的二维凝胶上蛋白点的光密度值或综合同位素标记后的质谱峰强度方法.但此二者的样品处理方法都比较麻烦,不利于进行大规模蛋白质组的定量研究.最近几年出现了利用质谱数据进行无标记定量的方法...
蛋白质是生物体内最重要的功能分子之一,研究蛋白质的表达水平和变化对于理解生物学过程和疾病机制至关重要。在过去的几十年里,科学家们开发了许多蛋白质组学技术,其中之一就是无标记定量蛋白质组学技术,也被称为label free技术。本文将详细介绍label free技术的原理、应用和优势。
在第三十九届世界眼科大会(WOC 2024)上,浙江大学医学院附属第二医院陈芝清教授分享了团队开展的“碘酸钠诱导小鼠的多模式眼底成像和无标记定量蛋白质组学”研究的结果,帮助眼科医师更好地了解AMD的发病机制,并提供了一个良好的动物模型,为未来相关领域的研究奠定了坚实基础。