蛋白质组学研究中的无标记定量方法 蛋白质定量是探索疾病发生发展状况和寻找新药靶标的重要手段.该领域最常用的技术是比较染色后的二维凝胶上蛋白点的光密度值或综合同位素标记后的质谱峰强度方法.但此二者的样品处理方法都比较麻烦,不利于进行大规模蛋白质组的定量研究.最近几年出现了利用质谱数据进行无标记定量的方法...
无标记定量蛋白质组学精子变形目的:利用无标记定量蛋白质组学技术筛选在3周龄及成年小鼠睾丸中差异表达的蛋白质。方法:分别抽提3周龄及成年小鼠睾丸蛋白,酶解后所得肽段经纳升液相色谱分离,并经LTQ Obitrap质谱鉴定,在获得蛋白鉴定信息的同时根据相应肽段离子质谱峰强度对蛋白进行相对定量。结果:在3周龄及成年小鼠睾...
5. 质谱分析 质谱分析是无标记半定量化学蛋白质组学的核心步骤。质谱技术可以定量测量样品中蛋白质的丰度，并通过不同样品间的比较来确定差异表达的蛋白质。优化质谱实验条件（如仪器的参数设置、分析方法的选择等），可以提高质谱分析的准确性和灵敏度。6. 数据分析 无标记半定量化学蛋白质组学产生大量数据，需要进行...
的二维凝胶上蛋白点的光密度值或综合同位素标记后的质谱峰强度方法.但此二者的样品处理方法都比较麻烦,不利于进行大规模蛋白质组的定量研究.最近几年出现了利用质谱数据进行无标记定量的方法,根据数据类型这些方法可以分为2类:基于鉴定蛋白的肽段数的方法和基于质谱峰强度的方法,在高通量大规模蛋白组定量研究中有很大...
无标记定量蛋白质组学精子变形目的: 利用无标记定量蛋白质组学技术筛选在3周龄及成年小鼠睾丸中差异表达的蛋白质?方法:分别抽提3周龄及成年小鼠睾丸蛋白,酶解后所得肽段经纳升液相色谱分离,并经LTQ Obitrap质谱鉴定,在获得蛋白鉴定信息的同时根据相应肽段离子质谱峰强度对蛋白进行相对定量?结果:在3周龄及成年小鼠睾...
无标记定量方法在小鼠精子发生相关蛋白质组学研究中的应用 目的: 利用无标记定量蛋白质组学技术筛选在3周龄及成年小鼠睾丸中差异表达的蛋白质?方法:分别抽提3周龄及成年小鼠睾丸蛋白,酶解后所得肽段经纳升液相色谱分离,并经LTQ... 王黎熔,王富强,郭雪江,... - 《南京医科大学学报(自然科学版)》 被引量: 0...
依靠质谱技术的蛋白质组学快速发展,寻求速度快、重复性好以及准确度高的定量方法是该领域的一项艰巨任务,定量蛋白质组学分支领域应运而生.其中,无标记定量方法以其样品制备简单、耗材费用低廉以及结果数据分析便捷等优点渐露锋芒.无标记定量方法通常分为信号强度法和谱图计数法两大类.本文在这两种无标记定量方法计算原...
本发明涉及一种结合二级质谱强度和机器学习算法的蛋白质组无标记定量方法,用于蛋白质组水平的绝对和相对定量分析.该方法首先需要在液相色谱-串级质谱系统上分析用于建立训练数据集的蛋白质组实际样品的酶解肽段混合物以及待分析的蛋白质组样品的酶解肽段混合物.样品总量可以通过细胞计数或测定蛋白浓度得知,根据上一步算...
无标记半定量化学蛋白质组学是一种重要的蛋白质组学方法,能够定量分析细胞或组织中蛋白质的差异表达情况。在这个过程中,样品准备是影响结果准确性的关键因素。优化样品准备步骤可以最大程度地保证实验的可靠性和重复性。 2. 样品前处理 在无标记半定量化学蛋白质组学中,样品前处理是首先需要考虑的步骤。这包括细胞裂...
无标记半定量化学蛋白质组学是一种重要的蛋白质组学方法,能够定量分析细胞或组织中蛋白质的差异表达情况。在这个过程中,样品准备是影响结果准确性的关键因素。优化样品准备步骤可以最大程度地保证实验的可靠性和重复性。 2. 样品前处理 在无标记半定量化学蛋白质组学中,样品前处理是首先需要考虑的步骤。这包括细胞裂...