整合子是一种遗传因素,包含一个能捕获外源基因的位点特异重组系统,这些被捕获的外源基因通常是耐药基因(如编码氨基糖苷类、β-内酰胺类、氯霉素、磺胺类等的基因)。这些耐药基因被包含在叫做基因盒的单一的移动单元。整合子由两个保守片段即5′端和3′端保守段组成,在5′端保守段包含有编码整合酶的Int基因、Int...
整合子是一种自由环状、双链DNA分子,在细菌基因组中通常以环状DNA的形式存在。整合子的基本结构由三个主要组成部分构成:5’端整合酶编码区(integron integrase、IntI),内部响应元件(integron-integrase 5’-conserved segment、5’-CS),以及3’端的整合子平台(gene cassette array、GCA)。 2.2 整合子的功能 整合子...
最常见的1类整合子,其3’保守区通常包含sul1、qacEΔ1基因和tni序列,但末端的tni序列经常被插入序列ISCR及其携带的基因簇所取代而形成更加复杂的杂合整合子结构。 在我们接手的一些项目中也经常观察到1类整合子相关区域在基因组上形成连续成片的多药耐药基因富集区,这可能也是1类整合子一个的重要特征。此外,我们发...
常见的1类整合子在3'区通常包含sul1、qacEΔ1基因和tni序列,但常因插入序列而形成更复杂的杂合结构。整合子在细菌中形成多药耐药基因富集区,增强细菌的耐药性。然而,基因组中整合子相关信息的预测和注释并不准确,特别是在3'区的qacEΔ1基因预测方面。Resfinder和CARD等工具的预测也可能存在局限性。
整合子啊,就像是一个超级收纳盒!打个比方吧,你家里有各种零碎的小物件,乱七八糟的,这时候有个神奇的盒子能把它们都规整起来,这盒子就是整合子啦! 整合子是一种遗传元件呢,它可牛了!它能够识别、捕获和整合外源基因。就好像它有一双敏锐的眼睛,能从茫茫基因海洋中找到那些它觉得有用的基因片段,然后“嗖”地...
图1 ISCR1介导的1类复合整合子移动 此外,在1类整合子的复合结构中,存在一类非常典型的情况,即1类整合子3’-CS的qacEΔ1基因和sul基因可能形成一份新的拷贝,如图2最下方的基因簇所示。这种结构的出现据推测与ISCR及邻近基序的同源重组相关。图2i/ii/iii显示了ISCR1在选择不同随机复制终点terIS的情况下,插入多...
以Ⅰ型整合子为例,基因盒通常以闭环形式存在,但通过整合酶IntI1的作用,它们可以形成线性结构,与整合子上的attI1和attc位点结合。这个过程是可逆的,一旦线性基因被切除,其两端的特殊结构会使其恢复成环状,并有机会再次整合到其他整合子上。一个整合子可以接纳多个基因盒,这种多重插入导致整合子...
生命的逻辑:整合子生命观概论 白书农 著 更新时间:2025-03-27 19:00:32 开会员,本书免费读 >最新章节: 参考文献 自然科学 生物科学 本书作者从事生命科学研究教学多年,结合自身研究经历,提出了对“生命”这一概念的深入思考,尝试构建整合子生命观。本书即整合子生命观的综合论述,并在这一构架下解释了许多生物...
Int,作为酪氨酸整合酶家族的一员,它编码的整合酶能识别并连接attI位点和基因盒的59-be家族成员(如attc位点)。重组过程主要发生在attI位点与59-be位点之间,但attI位点与attI位点之间的重组效率通常低于与59-be位点的重组。3'端保守片段的结构根据整合子的不同类型有所变化。基因盒则是独立存在的环形...