整合子(Integron)是一种特殊的基因结构,广泛存在于细菌中,特别是多重耐药菌株,能够捕获和表达外源基因,尤其是抗生素抗性基因。当细菌遇到抗生素压力时,这些整合子能快速整合耐药基因并传递给其他细菌,导致耐药性扩散。因此,这类遗传元件对于研究细菌的进化、抗生素耐药性传播等有着重要意义。 今天我们要学习的工具Integron F
一般来说一个整合子可以携带一个或多个耐药基因盒并启动这些耐药基因的表达,其基因盒的数量和种类将极大地丰富菌株的耐药谱,可以说整合子是细菌最重要的耐药基因储存库。 图1 整合子结构模式 从结构上来看,整合子包含5’保守区、基因盒可变区以及3’保守区。其中5’保守区主要包括整合酶基因以及启动子和初始整合...
在整合过程中,三种可能的反应形式会通过IntI催化:attI与59-be结合(attI×59-be)、59-be与59-be结合(59-be×59-be)以及attI与attI结合(attI×attI),但attI×attI的反应发生概率较低。以Ⅰ型整合子为例,基因盒通常以闭环形式存在,但通过整合酶IntI1的作用,它们可以形成线性结构,与整合子...
整合子由两个保守的组成部分构成:5'端和3'端保守片段。5'端保守片段包含关键组件,如编码整合酶的Int基因,以及Int特异性重组位点attI和负责基因转录的启动子P1(Pant)和P2(尽管P2在少数整合子中罕见)。Int,作为酪氨酸整合酶家族的一员,它编码的整合酶能识别并连接attI位点和基因盒的59-be家族成...
本研究应用了两种不同的PCR检测方法,使用从不同环境样本中分离的DNA,检测整合子整合酶和基因盒。PCR产物同时采用长读长牛津纳米孔(ONT)和短读长Illumina MiSeq测序技术进行测序。并且提出了一套流程,过滤完整的attC位点或intI基因的序列,以获...
被刘易斯称之为“同源异形盒基因”。整合子含有一种整合酶基因,可以将基因盒插入到整合子的特异部位 ...
)是最重要的开花整合子基因,也是近 年来高等植物花发育研究的热点。研究发现, FT及其 同源基因的表达产物不仅以成花素的形式参与了开花 在动物体内以Raf-1激酶抑制剂的形式被发现。在被子 植物中, PEBP蛋白包含3个系统发生差异种族的基因 蛋白,分别是 FT-LIKE 蛋白、 TFL1 蛋白和 MFT 蛋白 [5] 。 1937 年...
整合子常根据intI基DNA序列的不同进行分类,研究较多的主要有以下4类: 第一类整合子最常见,从临床菌株中发现的整合子大多属于此类。其整合酶IntI1含有337个氨基酸。5′CS有编码IntI1的基因intI1、重组位点attI1和启动子Pant。其中Pant位于IntI1的编码框内,有的整合子还有启动子P2[1]。大多数第...
不同的质粒,如JP2,包含着各种克隆整合子片段,这些片段的区别在于它们的启动子和耐药基因盒的组合。大部分基因盒没有独立的启动子,但研究发现有一个共同的启动子,被称为Pant。所有基因盒都按照编码区的同一方向插入,确保它们都以Pant启动子进行表达。Pant是大肠杆菌启动子的显著相似区域,其序列的改变...
人们在对于耐药机制的研究中发现,整合子是一种与耐药基因水平转移密切相关的克隆表达载体,是耐药基因储存和转移的重要结构。1991年Hall等人正式提出了基因盒 整合子(Genecassette)系统的概念。基因盒 整合子系统是一种具有位点特异性重组功能的可移动元件,由两个保守区及其间的基因盒构成,在事例酶的催化下可捕获和表达...