首先用鼠标选中裁剪区域(上方红色区域)。 再点击"Edit",选择"Deleta"进行删除 总结 Jalview的序列标识图比较美观,整体的美化和裁剪操作也很方便。导出图片后 (导出方法可参考之前推文),可利用AI等工具进一步修图,例如只保留序列比对图和序列标识图,并与前期的家系分析图和一代测序峰图合并、保存,最终插入到文章中使用...
1、序列比对 2、作图处理 序列比对 利用CLUSTALW网站可迅速完成比对,网址为Multiple Sequence Alignment - CLUSTALW (genome.jp) 以图中所示的PDB编号为 7EHW 和 5DW1 的2段序列作为演示,比对结果迅速弹出。 2. 下载比对结果 弹出的结果如下所示: 比对结果提供了 2 种格式的文件,分别为aln和 dnd 格式,点击...
1.多序列比对数据准备 这里我们我们利用上一篇文章的19条SPL15蛋白序列为例,利用MEGA7进行多序列比对。 导出比对好的多序列文件,命名为19.fas 2、导入多序列比对结果进GeneDoc 点击Done确定 2、多序列比对结果美化设置参数 点击C进去进行参数设置,点击Project,选择保守序列不显示,同时对字体颜色进行设置,点击确定 3、...
这样就可以启动 ESPript 的图形界面了。 使用ESPript:在 ESPript 界面中,可以上传多序列比对文件(如 FASTA 格式)和结构文件(如 PDB 格式),然后设置比对图的样式和颜色。最后点击 "Submit" 按钮即可生成漂亮的多序列比对图。 需要注意的是,如果在运行 ESPript 时遇到 Perl 模块缺失的问题,可以尝试使用以下命令安装...
首先选中比对序列 (下图红框),按照如下操作 Calculate 选择比对算法 序列的剪辑 文章中一般只展示目标区域,需对序列进行裁剪。首先用鼠标选中裁剪区域(上方红色区域)。 再点击"Edit",选择"Deleta"进行删除 总结 Jalview的序列标识图比较美观,整体的美化和裁剪操作也很方便。导出图片后 (导出方法可参考之前推文),可利用...
4️⃣ 打开GeneDoc软件,点击file-import,选择.aln格式文件,导入比对结果。5️⃣ 如果需要,可以设置黑白显示参数,或去除数量过多的序列。6️⃣ 最后,在GeneDoc中点击Edit-select block for copy,选中所有blocks(行),粘贴到word或PS进行进一步编辑。🎉 完成以上步骤,你的序列比对图就大功告成啦!快来试...
1 首先，打开ClustalX，依次在菜单栏选择“File”-“Load Sequences”导入我们的目的序列（fas格式）。2 然后进行完全比对，依次选择“Alignment”-“Do Complete Alignment”3 选择保存路径，点击“OK”。一般默认生成两个文件，分别是*.aln和*.dnd文件，可以用“记事本”打开。4 由于*.aln和*.dnd这两个文件的...
1.多序列比对数据准备 这里我们我们利用上一篇文章的19条SPL15蛋白序列为例,利用MEGA7进行多序列比对。 导出比对好的多序列文件,命名为19.fas 2、导入多序列比对结果进GeneDoc 点击Done确定 2、多序列比对结果美化设置参数 点击C进去进行参数设置,点击Project,选择保守序列不显示,同时对字体颜色进行设置,点击确定 ...