基因差异火山图看法如下: 火山图可反映总体基因的表达情况,横坐标代表log2(Fold Change),纵坐标表示-log10(P值),每个点代表一个基因,颜色用以区分基因是否差异表达,图中橙色的点代表差异表达基因,蓝色的点代表没有差异表达的基因。聚类图聚类图可以衡量样本或基因之间表达的相似性。 在聚类图中,横坐标代表样本聚类,...
logFC为负是下调,为正的是上调; 纵坐标为-log10(P-value)值,表示某个基因在比较分组之间的表达差异是否足够显著,一般认为p-value<0.05为显著。 根据作者设置的阈值:log2FC的绝对值为0.1,p值<0.05,因此灰色部分的基因不满足条件。 横着看基因与对照组的差异,竖着看有无统计学意义,在欣赏火山图时,我们只需要关...
基因差异火山图看法如下:火山图可反映总体基因的表达情况,横坐标代表log2(Fold Change),纵坐标表示-log10(P值),每个点代表一个基因,颜色用以区分基因是否差异表达,图中橙色的点代表差异表达基因,蓝色的点代表没有差异表达的基因。聚类图聚类图可以衡量样本或基因之间表达的相似性。火山图先关:火山图(Volcano Plot)...
②纵坐标解读:当P=0.05,-log10(P值)≈1.3,纵坐标越大于1.3,表示差异越显著(P越小,差异越大)。 ③横坐标解读:FC全拼是Fold Change(差异倍数),当FC=1.2,则log2(FC)≈0.26,当log2(FC)的绝对值越大于0.26,表示差异倍数越大。 ④蓝点表示表达显著下调基因(或蛋白)。 ⑤红点表示表达显著上调基因(或蛋白)。
基因差异火山图看法如下：火山图可反映总体基因的表达情况，横坐标代表log2（Fold Change）,纵坐标表示-log10（P值），每个点代表一个基因，颜色用以区分基因是否差异表达，图中橙色的点代表差异表达基因，蓝色的点代表没有差异表达的基因。聚类图聚类图可以衡量样本或基因之间表达的相似性。在聚类图中，横...
基因差异火山图看法如下：火山图可反映总体基因的表达情况，横坐标代表log2（Fold Change）,纵坐标表示-log10（P值），每个点代表一个基因，颜色用以区分基因是否差异表达，图中橙色的点代表差异表达基因，蓝色的点代表没有差异表达的基因。聚类图聚类图可以衡量样本或基因之间表达的相似性。在聚类图中，横...
1.火山图的定义&用途 2.结合具体案例怎么看? 3.火山图的相关疑问&解答 01 火山图的定义&用途 定义:在一张图里显示了两个重要指标(Fold change/p-Value),主要用于展示两组样本间基因表达的显著差异。 用途: 差异表达可视化:可直观显示基因或蛋白质表达差异。
1.火山图的定义&用途 2.结合具体案例怎么看? 3.火山图的相关疑问&解答 01 火山图的定义&用途 定义:在一张图里显示了两个重要指标(Fold change/p-Value),主要用于展示两组样本间基因表达的显著差异。 用途: 差异表达可视化:可直观显示基因或蛋白质表达差异。