2.神经胶质细胞: 神经胶质细胞是神经组织中的非神经细胞,主要承担起支持、维持和修复神经元的功能。在小鼠单细胞分群中,神经胶质细胞可以通过一些特定的marker基因来鉴定,比如Aqp4、Gfap、Optc等。这些基因主要参与神经胶质细胞的结构和功能,通过它们的表达水平可以鉴定出神经胶质细胞。 3.免疫细胞: 小鼠的免疫系统中含有...
在研究单细胞小鼠细胞时,Marker的应用尤为重要。本文将介绍一些常用的单细胞小鼠细胞Marker,帮助读者更好地了解这个领域的研究进展。 1. CD45:CD45是一种常见的免疫细胞Marker,用于鉴定白细胞的存在。在单细胞RNA测序中,CD45可以帮助我们区分免疫细胞和非免疫细胞,从而更好地理解细胞组成和功能。 2. CD31:CD31是...
选取出生后第1、3、7、21和56天的小鼠肝脏细胞进行单细胞转录组测序,构建了小鼠从出生到成熟整个肝脏发育时期的单细胞转录组图谱。 03 研究结论 1. 出生后早期肝脏中肝细胞的异质性 对测得的52834个细胞进行UMAP分类,并注释成31个簇,其中包括肝细胞(来自D1,D3和D7的肝新生儿;Hep-D21;Hep-D56),内皮细胞(...
综合多篇已发表高水平文章,不难发现,通过单细胞测序可以获得新的细胞群及其特异的marker基因,接下来,一方面可以利用基于基因修饰技术的谱系示踪小鼠在体内系统中实现对新细胞群的跟踪分析(即细胞谱系示踪研究方向);另一方面,也可以通过基因修饰技术构建条件性基因敲除...
单细胞转录组测序分析显示纹状体中有10种不同的细胞类型——神经元、星形胶质细胞、少突胶质细胞、室管膜细胞、免疫细胞和血管细胞。 此外,作者确定了两种中棘神经元(MSNs)的亚型,它们具有特定的maker基因。同时发现,marker基因Sp9过表达后与认知障碍和成瘾相关。作者同时还描述了在所有MSN亚型和星形胶质细胞表达谱的连...
其他组织(心脏、骨骼肌)中的毛细血管内皮细胞普遍表达AQP7,但AQP7在肠毛细血管内皮细胞中的表达尚未见报道,可能是因为它只在这些细胞的一小部分中表达。尽管如此,Aqp7+毛细血管内皮细胞可能具有特殊的生理作用。此外,如图5A所示,作者鉴定了一小部分(4.7%-5.0%)肠静脉内皮细胞marker(EC markerBgn)的表达,其具有丰富...
1.marker gene; 2.反卷积思想 算法本身的逻辑不需要掌握,只需要知道两种算法得到的免疫浸润结果是不同的 反卷积算法得到的是每个样本免疫细胞的比例 marker gene算法得到的是每一个样本某个细胞的富集分数 也就是说尽管免疫浸润的方法有很多,但是...
综合多篇已发表高水平文章,不难发现,通过单细胞测序可以获得新的细胞群及其特异的marker基因,接下来,一方面可以利用基于基因修饰技术的谱系示踪小鼠在体内系统中实现对新细胞群的跟踪分析(即细胞谱系示踪研究方向);另一方面,也可以通过基因修饰技术构建条件性基因敲除或条件性细胞剔除小鼠进行功能研究(即基因或细胞功能研究方...
首先,需要强调的是CellKb Immune所有用于细胞注释的marker genes都是作者通过搜集以发表的研究手动整理的,其中包括各种免疫功能调节相关的文章。为了保证marker genes来源的可靠性,所有被纳入进CellKb Immune基因必须满足以下标准: 1)Deposition of raw data in public databases; 2)Availability of data for download; ...
文献解读:小鼠内皮细胞的单细胞转录图谱摘要各种组织中上皮细胞(Endothelial cells, EC) 的异质性依然没有被完全解析。研究构建了来自于11个小鼠组织中的超过32000个单上皮细胞的转录组数据的图谱,并识别到78个上皮细胞亚集,包括健康组织中的==Aqp7+小肠==(肠道)==毛细血管及健康组织中的生成血管==血管生成==...