2.神经胶质细胞: 神经胶质细胞是神经组织中的非神经细胞,主要承担起支持、维持和修复神经元的功能。在小鼠单细胞分群中,神经胶质细胞可以通过一些特定的marker基因来鉴定,比如Aqp4、Gfap、Optc等。这些基因主要参与神经胶质细胞的结构和功能,通过它们的表达水平可以鉴定出神经胶质细胞。 3.免疫细胞: 小鼠的免疫系统中含有...
在研究单细胞小鼠细胞时,Marker的应用尤为重要。本文将介绍一些常用的单细胞小鼠细胞Marker,帮助读者更好地了解这个领域的研究进展。 1. CD45:CD45是一种常见的免疫细胞Marker,用于鉴定白细胞的存在。在单细胞RNA测序中,CD45可以帮助我们区分免疫细胞和非免疫细胞,从而更好地理解细胞组成和功能。 2. CD31:CD31是...
回到这篇文章中,对脑膜免疫细胞分类7个大群:border-associated macrophages (BAMs), microglia-like cells, monocytes, neutrophils, T cells, ILCs, and B cells ,figure1主要就是细胞分群,细胞比例、marker基因热图以及UMAP展示,做类似研究的小伙伴可以参考一下,相关图绘制及分析方法在单细胞天地内搜都可以找到的。
综合多篇已发表高水平文章,不难发现,通过单细胞测序可以获得新的细胞群及其特异的marker基因,接下来,一方面可以利用基于基因修饰技术的谱系示踪小鼠在体内系统中实现对新细胞群的跟踪分析(即细胞谱系示踪研究方向);另一方面,也可以通过基因修饰技术构建条件性基因敲除...
近年来,对肝脏的细胞类型和发育过程有一定研究进程,单细胞RNA测序已被用于表征小鼠肠道内胚层和原肠胚的形成,表明了肝脏发育的开始。但目前对肝脏的全部细胞类型以及出生后的肝脏发育过程还存在认知盲区。 在本研究中,对所有主要的肝细胞类型进行分离,在单细胞的分辨率下全面对小鼠出生后的肝脏发育进行解读。
单细胞转录组测序分析显示纹状体中有10种不同的细胞类型——神经元、星形胶质细胞、少突胶质细胞、室管膜细胞、免疫细胞和血管细胞。 此外,作者确定了两种中棘神经元(MSNs)的亚型,它们具有特定的maker基因。同时发现,marker基因Sp9过表达后与认知障碍和成瘾相关。作者同时还描述了在所有MSN亚型和星形胶质细胞表达谱的连...
其他组织(心脏、骨骼肌)中的毛细血管内皮细胞普遍表达AQP7,但AQP7在肠毛细血管内皮细胞中的表达尚未见报道,可能是因为它只在这些细胞的一小部分中表达。尽管如此,Aqp7+毛细血管内皮细胞可能具有特殊的生理作用。此外,如图5A所示,作者鉴定了一小部分(4.7%-5.0%)肠静脉内皮细胞marker(EC markerBgn)的表达,其具有丰富...
1.marker gene; 2.反卷积思想 算法本身的逻辑不需要掌握,只需要知道两种算法得到的免疫浸润结果是不同的 反卷积算法得到的是每个样本免疫细胞的比例 marker gene算法得到的是每一个样本某个细胞的富集分数 也就是说尽管免疫浸润的方法有很多,但是...
单细胞测序结果描绘了Mecp2缺陷小鼠脑膜的免疫细胞景观。Mecp2缺陷小鼠脑膜表现出更高的免疫细胞群多样化，B细胞明显多于对照小鼠，免疫球蛋白相关基因的表达显着更高，且含有更多的细胞毒性CD8 T细胞。随着T细胞和NK细胞中IFN-γ转录的增加，Mecp2缺陷小鼠中脑膜巨噬细胞的抑制减少、活性增加。这些发现提供了对脑膜...
综合多篇已发表高水平文章,不难发现,通过单细胞测序可以获得新的细胞群及其特异的marker基因,接下来,一方面可以利用基于基因修饰技术的谱系示踪小鼠在体内系统中实现对新细胞群的跟踪分析(即细胞谱系示踪研究方向);另一方面,也可以通过基因修饰技术构建条件性基因敲除或条件性细胞剔除小鼠进行功能研究(即基因或细胞功能研究方...