其中,与健康皮肤相比,PASI中度组、重度组、皮损组和非皮损组C. simulans丰度均增加。研究进一步将转录组与皮肤微生物组进行关联,发现C. simulans和C. acnes的丰度与几个中心宿主基因的表达显著相关。 图5C. simulans在银屑病皮损中富集,并与银屑病发病机制相关的宿主基因相关 5、微生物基因家族分析揭示两种银屑
近日,《生物技术通报》在线发表了题为《复配菌群降解煤产甲烷的宏基因组与宏转录组分析》的研究报告。本文采用沁水盆地东南部煤层气井产出水为菌种来源,以褐煤为碳源富集产甲烷菌群(RI),以菲为碳源富集芳香化合物降解功能菌群,并通过功能菌群与...
其中,与健康皮肤相比,PASI中度组、重度组、皮损组和非皮损组C. simulans丰度均增加。研究进一步将转录组与皮肤微生物组进行关联,发现C. simulans和C. acnes的丰度与几个中心宿主基因的表达显著相关。 图5 C. simulans在银屑病皮损中富集,并与银屑病发病机制相关的宿主基因相关 5、微生物基因家族分析揭示两种银屑病...
图1. 宏基因组二代（医学）reads分析流程图 图2. 宏转录组（医学）reads分析流程图 宏基因组二代（医学）是通过直接从医学样品中提取DNA，利用高通量测序技术对所有微生物的遗传物质进行测序，从而研究微生物群体的组成、多样性及功能。宏转录组（医学）专注于研究特定医学环境下微生物群落的所有mRNA，以揭示其在...
宏转录组学分析发现,编码硫化物-醌氧化还原酶(SQR)基因的群落表达量是黄素细胞色素c硫化物脱氢酶亚基B(fccB)的10倍。此外,SQR的表达水平也显著高于编码异化硫酸还原酶的Dsr基因,后者编码一种关键的S0氧化酶。宏基因组分箱分析证实,利用SQR的硫化物氧化细菌(SOB)在微生物群落中很常见,这很可能是高S0产量的原因。产...
宏转录组(医学)专注于研究特定医学环境下微生物群落的所有mRNA,以揭示其在特定条件下的表达模式。宏基因组二代(医学)和宏转录组(医学)reads分析流程,涵盖物种注释、物种与功能组成分析、样本比较分析、组间比较分析、物种与功能差异分析、环境因子关联分析等多个分析模块,为探索微生物与疾病的相互作用关系提供了新的...
利用宏基因组学和宏转录组学联合分析产甲烷菌群和复配菌群在煤降解产气后的微生物群落和代谢途径差异。门水平上,在宏基因组和宏转录组中复配均显著提高了Proteobacteria的相对丰度,可以降解煤中的芳香烃,利用各种有机底物产生挥发性脂肪酸,在碳循环中起着关键作用。宏基因属水平上,Pseudomonas是两组微生物共有优势菌...
降解宏基因组是指对一个生态系统中所有微生物的基因组进行分析,这些微生物可能包括细菌、古菌、真菌和原生动物等。通过对这些微生物的基因组进行分析,可以了解它们在特定环境中的功能和相互作用。降解宏基因组的研究通常涉及到从环境样品中提取微生物DNA,然后利用高通量测序技术对其进行测序和分析。这种研究有助于揭示微...
然而,肉牛品种对瘤胃微生物群落的影响程度及其与饲料转化率之间的关系尚不清楚。 本研究利用宏基因组学和宏转录组学,对48头三个肉牛品种(安格斯、夏洛来,Kinsella杂交)的饲料转化率(高和低)和瘤胃微生物进行了比较,旨在找出其瘤胃微生物组成、功能潜力和功能活性的差异,并评估肉牛品种和饲料转化率对瘤胃微生物群落...
宏基因组学测序、单细胞测序、转录组、翻译组测序、生信个性化分析、课题设计、文章基金协助,实验外包 一、代谢性疾病 1. 2型糖尿病(T2DM)肠道菌群-代谢物互作网络 核心问题:肠道菌群通过何种代谢物(如短链脂肪酸、次级胆汁酸)调控宿主胰岛素抵抗? 研究对象: ...