日前，东南亚基因组计划宣布构建了目前最完整的东南亚人群基因组变异数据集—SEA3K，全球人群基因组研究填上了“最后一块拼图”。就相关问题，观察者网科普作者岑少宇对话了复旦大学生命科学学院人类学系青年研究员王轲。观察者网：东南亚基因组计划是人类基因组研究的一大进展，对于分析人类的演化过程，也有很重要的意义。...
本研究首次通过基因组数据发现，云南中部距今5,500至1,400年的人群，携带一种迄今未被识别的独特东亚祖源，不同于东亚古北方或古南方人群。研究团队将其命名为“云南中部祖先人群”，并发现这一祖源与当今南亚语系人群密切相关，表明云南可能是南亚语系族群的早期核心区域之一。科研团队结合考古学、语言学和遗传学证据...
贺福初（中国科学院院士）：人类基因组计划最大的贡献在于推动核酸测序能力的“超摩尔定律”增长，进而催生了基因组学驱动的生物医学研究范式变革。时至今日，基因组学已迈入“成熟期”。其他生命组学方面，蛋白质组学仍有“成长的烦恼”，代谢组学“方兴未艾”。因此，我们虽已进入基因组时代，但仍呼唤多组学或生命...
基因组(Genome):分子生物学和遗传学领域中指生物体所有遗传物质的总和,包括DNA或RNA(病毒)。DNA具体包含编码DNA、非编码DNA、线粒体DNA和叶绿体DNA。研究基因组的科学称为基因组学。 同源染色体(Homologous Chromosomes):一个物种中形态和结构基本相同的染色体。在二倍体生物细胞中,同源染色体在减数第一次分裂的四分体...
1、常用人参考基因组对应表 根据GRC 官网信息,GRCh39 大版本将会无限停更,他们在考虑用新模型和序列来构建人类的参考基因组,细节不清楚,猜测有可能会有泛基因组内容。 2、常用小鼠参考基因组对应表 三、下载 1、NCBI 这里提供两种下载方式,一种为网页界面下载,另一种为FTP下载。
一、从NCBI下载参考基因组数据 二、从Ensembl下载参考基因组数据 三、从GENCODE下载数据 一、从NCBI下载参考基因组数据 NCBI改版后网上搜索的教程变得不太一样了,这里对新版的参考基因组下载进行整理 1、首先,打开NCBI官网搜索人类基因组(human 或者 homo),找到组装基因组数据(Assembly / Genome) National Center for...
做共线性分析之前需要区分两个描述基因组共线性的名词: Synteny:两个物种的一组基因位点,在每个物种中位于同一条染色体(顺序不一定相同)。 Collinearity:两个物种的一组基因位点,分别位于各自的同一条染色体上,并且顺序也是一致的。 这里染色体打了个重点,因为所有的共线性分析都是基于染色体水平的基因组进行比较的,...
人类基因组概况: 人类基因组由ATCG四种碱基组成,但是CG的含量低于50%,所以CG含量低于AT含量。 一个基因组的dna大约3ug。 snp: 平均每100到1000个碱基会出现1个SNPs,不过密度并不均匀。 如果按照每1000个碱基存在1个SNP来计算,人类30亿个碱基中,大约有300万个SNPs。
新华社北京5月30日电（记者温竞华）记者从中国科学院古脊椎动物与古人类研究所获悉，我国科学家捕获和测序了百余例距今7100年以来的云南古代人类基因组，填补了东亚和东南亚史前人群遗传数据的关键空白，并首次从遗传学角度明确了青藏高原人群的“幽灵祖先”的来源。上述研究由中国科学院古脊椎所付巧妹研究团队联合云南...