但细胞分析通量低且成本高。Smart-seq3是最近发展的单细胞转录组测序新方法，引入分子编码对mRNA进行定量统计，使转录本长度增加，灵敏度进一步提高，但仍然无法同时满足高通量、高基因检出能力和低成本的需求。为解决这一问题，该技术的开发者瑞典卡罗林斯卡学院的Rickard团队进一步开发了Smart-seq3xpress技术。图1：Smart...
Smart-seq2技术有较好的覆盖范围,可检测到稀有转录本,无需额外的专业设备,应用范围较广,可以解决传统 RNA 定量技术在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免疫等研究领域中存在的样品量极低或细胞异质性的问题,是在单细胞水平研究基因表达强有力的...
Smart-seq2 单细胞转录组测序通过 SMART 扩增技术对单个细胞中的 mRNA 进行逆转录和 PCR 扩增,结合转座酶建库技术,最终使用高通量测序手段,对单细胞中 mRNA 进行基因表达定量、功能富集、代谢通路等分析。它可以解决传统 RNA 定量技术在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免疫等研究领域中存在的样品量极低或细胞异质性的...
Smart-seq2技术在单细胞水平对带Poly(A)的RNA进行全长转录组扩增及高通量测序,能够满足高灵敏度、低偏好性的cDNA扩增,得到全长转录本,实现高水平的序列模板转换。 Smart-seq2技术有较好的覆盖范围,可检测到稀有转录本,无需额外的专业设备,应用范围较广,可以解决传统 RNA 定量技术在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免...
Smart-seq2技术于2013年公布,在单细胞水平对带poly(A)尾巴的RNA分子(主要为mRNA)进行转录组全长扩增及高通量测序的一种高端技术,具体方法采用改进的Smart-seq2技术,能够满足高灵敏度、低偏好性的cDNA扩增,对转录本的整体覆盖情况进行了完善,实现了高水平的序列模板转换。在分析不同细胞间差异表达之外,还能深入检测...
Smart-seq2的基本实验流程包括单细胞分选、反转录(第一链合成)、模板置换(第二链合成)、cDNA扩增、文库构建、上机测序以及生信分析的过程。 图2 Smart-seq2的基本实验流程 具体而言,先使用流式细胞仪或者显微切割等方法获取单细胞并置于微孔板中,然后进行细胞裂解。随后在裂解液中加入含有oligo(dT)的引物反转录合成...
Smart-seq2的测序流程包括单细胞分离、细胞裂解、RNA反转录、cDNA合成、常规PCR扩增和构建Illumina测序文库。整个过程旨在高效扩增微量细胞样本，提供全面的转录组信息，检测灵敏度高，碱基分辨率可达单碱基水平，实验可控性强。Smart-seq2技术优势显著，包括模板起始量低、转录本覆盖度高、检测灵敏度高、碱基...
不是,单细胞转录组全长测序是指mRNA全长测序。采用改进的Smart-seq2技术,能够满足高灵敏度、无偏好性的cDNA扩增,在分析不同细胞间差异表达之外,还能深入检测到细胞内融合基因、可变剪切、基因突变等信息。 02.提问 单细胞转录组全长测序,测序数据量能达到普通测序吗?这里面有多少是有用的?
Smart-seq2技术通过对带Poly（A）的RNA进行全长转录组扩增及高通量测序，实现高灵敏度、低偏好性的cDNA扩增，能够获得全长转录本，提供高水平的序列模板转换。此技术在单细胞水平上应用广泛，尤其在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免疫研究等领域，能够有效处理样品量极低或细胞异质性的问题。Smart-seq2技术...
Smart-seq2技术是一种用于检测单细胞水平下转录组的高精度、高覆盖率方法，与10x Genomics技术在技术层面具有一致性，但具有更高的灵活性、精度、覆盖率。该技术可以在单细胞水平下进行全长mRNA测序，支持对未知mRNA序列的样品进行检测，最低支持单个细胞或10pg RNA总量为模板。其检测的覆盖率和灵敏度足以...