单细胞 Hi-C 技术的主要步骤包括: 单细胞分离:单细胞被分离出来,通常使用流式细胞术或微操作技术。 单细胞 Hi-C:对单细胞进行 Hi-C 技术操作,包括交联、切割、连接、测序和生物信息学分析。 数据分析:分析单细胞 Hi-C 数据,揭示不同细胞之间的基因组结构差异。 单细胞 Hi-C 技术为研究细胞类型间的基因组结...
通过这种方式，scNanoHi-C 能够在一次 PromethION 测序中对少至几个单细胞进行低通量、高覆盖度测序或者对数千个单细胞（最高可达 24×96=2304个细胞）进行高通量、低覆盖度测序，可以根据实验需求灵活进行选择（图1）。为了评估scNanoHi-C技术的可靠性，该研究首先将scNanoHi-C应用于正常二倍体的GM12878细胞系...
研究团队结合色质构象捕获技术与商业化的细胞包裹微滴产生平台,开发出全新高通量单细胞染色质构象捕获技术——Droplet Hi-C,大幅提高了单细胞Hi-C的实用性,为研究三维基因组在发育与疾病中的作用及临床诊断提供了新工具。 为了突破这些局限,研究团队开发了基于商业化单细胞高通量微流控平台(10x Genomics)的Droplet Hi...
近年来,基于混合的植物组织或器官的多细胞水平,已经运用原位Hi-C技术解析了部分植物物种的染色质三维空间结构,但是都只是成千上万个不同细胞的平均值结构,细胞间的染色质3D构型的差异只能通过单细胞水平进行观察和研究。 为了研究单个植物细胞的染色质空间结构,作者开发了一种高分辨率的植物单细胞原位Hi-C技术,对从水...
研究团队使用Droplet Hi-C绘制了小鼠皮质的染色质结构图,并分析了主要皮质细胞类型中的基因调控程序。此外,研究团队还使用Droplet Hi-C检测了人类胶质母细胞瘤、结直肠癌和血液癌症细胞的拷贝数变化、结构变异和染色体外DNA(ecDNA),揭示了治疗过程中的克隆动力学和其他致癌事件。经过改进后,这项技术可以对单细胞中的...
作者对开花植物水稻受精前后的配子、合子和叶肉细胞的染色质空间结构进行了分析研究,开发了一种高分辨率的单细胞原位Hi-C技术,首次从单细胞的水平揭示了植物染色质空间结构在受精前后的构型动态变化特征及其与基因表达调控之间的关系,为研究植物的ZGA(zygotic genome activation)、胚胎发育和表观遗传调控,解析亲本基因组...
发布了头条文章:《植物单细胞Hi-C技术助力解析水稻配子、合子单细胞3D基因组结构》 http://t.cn/AiHYOPRu
安诺单细胞测序技术全面涵盖基因组、转录组和表观组三大组学,拥有50多种物种的丰富项目经验,单细胞建库质量达到顶级期刊水平;同时,安诺Hi-C技术团队对Fqtools_plus、HiC-Pro、iced和Fit-Hi-C等软件进行了大量优化和改进,在保证结果准确度的基础上大大缩短了Hi-C信息分析周期,为广大科研工作者提供更加快速和精准的...
本试剂盒是简单快速从单细胞到cDNA的一步法试剂盒,无需复杂的RNA提取步骤,就可以从1-1000个细胞中获得cDNA。因为细胞数少,RNA比较少,所以本试剂盒是将逆转录和预扩增同时进行。只需预先设计预扩增引物,就可以获得高质量的cDNA。 二、产品组分 三、保存条件 ...
而现有的单细胞Hi-C(single-cell Hi-C,scHiC)技术受限于二代测序较短的读长(通常是双端总共300bp)也难以对染色质高阶相互作用进行检测。目前除了单细胞超分辨率成像以外,2022年开发的scSPRITE5是唯一一种可以在单细胞水平检测染色质高阶相互作用的测序方法。但是该方法更适用于远距离的间接染色质高阶相互作用,...