最常见的单细胞测序的应用是在肿瘤研究上。来自美国和英国的研究人员近日利用单细胞基因组扩增、测序和装配,从海洋样本中鉴定出一个单细胞细菌。技术实例 多重退火和成环循环扩增技术(Multiple Annealing and Looping-Based Amplification Cycles, MALBAC)主要研发人:哈佛大学终身教授、美国科学院院士谢晓亮(Sunney Xie...
单细胞测序技术(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq)是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组等遗传信息进行高通量测序分析的一项新技术,可以研究单个细胞内的基因表达情况,同时解决用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题,让解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系...
单细胞全基因组测序技术,是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是将分离的单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增,获得高覆盖率的完整的基因组后进行高通量测序用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。内容 从方法学角度来看,获得高覆盖率高保真性的全基因组扩增产物是准确全面的测序结果的保障。多...
单细胞测序技术以单个细胞作为对象,通过对单个细胞遗传物质均匀扩增,标记建库后进行测序,最后对单个细胞基因组或转录组展开数据分析,其技术原理主要包括单细胞分离、扩增测序和数据分析3方面。 单细胞分离:主要包括荧光激活细胞分选法( flow- activated cell sorting ,FACS) 以及微流控分选法( microfluidics) 等。市场上...
单细胞测序是一种在单个细胞水平上进行基因组、转录组或表观基因组测序的技术。这种技术的出现,使得科学家可以深入研究细胞间的异质性,以及这种异质性如何影响生物学过程和疾病。在过去,由于技术限制,研究者只能测量组织样本中所有细胞的平均行为,这无法揭示细胞间的差异。通过单细胞测序,我们现在可以观察到每个细胞...
一、单细胞测序技术概述 二、单细胞测序技术的应用 2.1 肿瘤亚细胞群测序 2.2 免疫系统测序 2.3 体外受精的胚胎测序及无创产前检测 2.4 神经类疾病的应用 2.5 血液系统疾病的应用 2.6 临床微生物检测 2.7 精准医疗 三、单细胞转录组测序技术的原理及流程
单细胞测序流程包括:单细胞的分离制备、遗传物质的提取扩增以及遗传物质的高通量测序。 01 //细胞分离 相比传统测序,单细胞测序需要先将组织或体液中的细胞群分离成单个细胞,而这也恰恰是难点之处。 主要的技术包括梯度稀释法、显微操作技术、荧光激活细胞分选、微流控技术和激光捕获显...
1. 什么是单细胞测序 在前面我们介绍了测序技术的发展历史,以及测序技术的基本原理。在这一节,我们将真正的进入到单细胞测序的领域,介绍单细胞测序的基本原理,以及单细胞测序的应用。 在细胞的整个周期内,基因组、表观组、转录组和蛋白组是相互作用和相互调控的[1]。基因组和表观组的改变影响了转录本和蛋白的改...
自此,单细胞测序技术被广泛应用于基础科研和临床研究。单细胞在许多领域都占有一席之地,对于癌症早期的诊断、追踪以及个体化治疗具有重要意义。 一.基本原理单细胞测序首先不是仅仅对一个细胞进行测序,而是说该项技术能对单一细胞的基因组或转录组进行测序,可以理解为单细胞水平上的测序。 在介绍基本原理之前先让我们尝...
单细胞测序技术首次由Tang et al. 于2009年发表,用以比较单细胞测序和微芯片技术。2011年Islam et al.创建了第一个复用scRNA测序库,它的规模和通量的增加为3年后scRNA-seq的广泛普及奠定了基础。新平台只需两步就可以使单细胞分离和文库生成,它的出现改变了单细胞测序成本高、人力需求高且protocols有限的现状。