分子对接是结合分子建模和计算机模拟技术,它可以利用计算机模拟技术对未知分子进行精确的拼接,从而得到两个分子之间的结合模式。分子对接的优势在于,它可以有效地预测蛋白质的结合模式,模拟蛋白质之间的相互作用,并预测蛋白质的结构与功能之间的关系。 同源建模和分子对接技术一直在不断发展,如果能够更好地应用这两种技术,...
分子对接是同源建模技术的补充，是一种将两个分子进行尺度计算和旋转，并最大限度地匹配它们在局部空间上形状和位置的一种计算机技术。它以Bio-Conjugate数据库作为基础，通过实验数据及计算机模拟建立复杂分子结构，有助于研究者更好地掌握受体分子的结构和功能，并可以快速预测作用剂和受体之间的潜在作用和反应产物的...
作者通过应用Discovery Studio软件进行同源建模、分子对接等模拟手段发现了虾夷扇贝使人感到鲜味的重要多肽,通过这种方法可以筛选和鉴定更多新的鲜味肽,并进一步分析不同鲜味肽与鲜味受体的相互作用机制。
作者通过应用DS软件进行同源建模、分子对接等模拟手段发现了虾夷扇贝使人感到鲜味的重要多肽,通过这种方法可以筛选和鉴定更多新的鲜味肽,并进一步分析不同鲜味肽与鲜味受体的相互作用机制。 END 01 Discovery Studio软件介绍 BIOVIA Discovery Studio 是一款生命科学分子模拟软件,它为研究人员提供了一个完整的工具集,用于探...
通过RNA干扰、碱基突变、体外酶活性分析、同源建模和分子对接等方法研究SrUGT76G1的功能和分子机制,充分证明了SrUGT76G1在甜菊糖苷糖基化步骤中的重要作用。农杆菌介导的瞬时基因沉默降低了SrUGT76G1基因的表达,导致总糖苷含量显著下降...
基于同源建模和分子对接技术研究不同物种乙酰胆碱酯酶和有机磷农药的相互作用
同源建模活性区域分子动力学模拟该研究以来源于家蚕的碳酸酐酶为研究对象,利用同源建模建立了家蚕碳酸酐酶的三维结构并预测了其潜在的活性区域.随后,利用Autodock-Vina对家蚕碳酸酐酶和底物进行分子对接,分析和评价了对接模型以及与乙酸对硝基苯酯底物对接过程中的相互作用.经分子动力学模拟和MM/PBSA,分析催化过程中家蚕...
计算机辅助药物设计方法7同源建模和分子对接软件应用实例介绍 1 受体与拮抗剂相互作用模式研究 模拟A1受体的跨膜段三维结构 （MOE软件） 研究A1、A2A、A3受体与拮抗剂的相互作用模式（DOCK软件）计算机辅助药物设计概论－第15讲 蛋白质结构预测 2 同源建模 构建三维结构确定A1受体跨膜区域坐标替换...
3.3同源建模及分子对接揭示SrUGT76G1变异序列功能差异 4讨论 综上所述,本研究基于功能有差异的各SrUGT76G1变异序列,采用同源建模和分子对接的方法揭示了其结构和功能之间的关系,这为今后通过分子设计来改变其空间结构,从而获取高效变异序列积累了一定的科学数据。
同源模建法根据蛋白序列的相似性构建模拟蛋白的结构,是目前最成熟的预测蛋白结构的一种方法,而分子对接是研究分子间(如配体和受体)相互作用,并预测其结合模式和亲和力的一种理论模拟方法。近年来,同源建模和分子对接方法已成为计算机辅助药物研究领域的一项重要技术,在数据库搜寻,组合库设计及蛋白作用研究方面得到了广泛...