分子对接是结合分子建模和计算机模拟技术,它可以利用计算机模拟技术对未知分子进行精确的拼接,从而得到两个分子之间的结合模式。分子对接的优势在于,它可以有效地预测蛋白质的结合模式,模拟蛋白质之间的相互作用,并预测蛋白质的结构与功能之间的关系。 同源建模和分子对接技术一直在不断发展,如果能够更好地应用这两种技术,...
作者通过应用Discovery Studio软件进行同源建模、分子对接等模拟手段发现了虾夷扇贝使人感到鲜味的重要多肽,通过这种方法可以筛选和鉴定更多新的鲜味肽,并进一步分析不同鲜味肽与鲜味受体的相互作用机制。
同源建模和分子对接方法的应用与发展 1 同源建模 原子的结构模型的建立是构建分子模型的前提，而分子的同源建模则是以参考分子的原子坐标及其相互间的配位为基础，有统计学方法和量子化学方法综合运用，建立更为详细精确的分子结构模型的过程。它为区分复杂分子同源体之间的微小差异以及开发新蛋白质特性提供了参考，如3D...
作者通过应用DS软件进行同源建模、分子对接等模拟手段发现了虾夷扇贝使人感到鲜味的重要多肽,通过这种方法可以筛选和鉴定更多新的鲜味肽,并进一步分析不同鲜味肽与鲜味受体的相互作用机制。 END 01 Discovery Studio软件介绍 BIOVIA Discovery Studio 是一款生命科学分子模拟软件,它为研究人员提供了一个完整的工具集,用于探...
基于同源建模和分子对接技术研究不同物种乙酰胆碱酯酶和有机磷农药的相互作用
3.3同源建模及分子对接揭示SrUGT76G1变异序列功能差异 4讨论 综上所述,本研究基于功能有差异的各SrUGT76G1变异序列,采用同源建模和分子对接的方法揭示了其结构和功能之间的关系,这为今后通过分子设计来改变其空间结构,从而获取高效变异序列积累了一定的科学数据。
计算机辅助药物设计方法7同源建模和分子对接软件应用实例介绍 1 受体与拮抗剂相互作用模式研究 模拟A1受体的跨膜段三维结构 （MOE软件） 研究A1、A2A、A3受体与拮抗剂的相互作用模式（DOCK软件）计算机辅助药物设计概论－第15讲 蛋白质结构预测 2 同源建模 构建三维结构确定A1受体跨膜区域坐标替换...
同源模建法根据蛋白序列的相似性构建模拟蛋白的结构,是目前最成熟的预测蛋白结构的一种方法,而分子对接是研究分子间(如配体和受体)相互作用,并预测其结合模式和亲和力的一种理论模拟方法。近年来,同源建模和分子对接方法已成为计算机辅助药物研究领域的一项重要技术,在数据库搜寻,组合库设计及蛋白作用研究方面得到了广泛...
做的胰蛋白酶抑制剂的同源建模和分子对接。在ds上做了以下步骤。对同源建模初始结构优化的时候出现了问题,用的standard dynamics cascade。后面后面三项时间设置都是5ps。结构优化后反而分数变低了。也分步骤做了standard dynamics cascade。平衡得出结果还好,最后一步production结构又变差了。还有最优构想是选择最后一个...
同源模建法根据蛋白序列的相似性构建模拟蛋白的结构,是目前最成熟的预测蛋白结构的一种方法,而分子对接是研究分子间(如配体和受体)相互作用,并预测其结合模式和亲和力的一种理论模拟方法.近年来,同源建模和分子对接方法已成为计算机辅助药物研究领域的一项重要技术,在数据库搜寻,组合库设计及蛋白作用研究方面得到了广泛...