为了解决上述问题,同时促进草莓的基因鉴定和育种改进,近期中国农业科学院郑州果树研究所和中国农业科学院深圳农业基因组研究所等团队,为红颜草莓组装了一个高质量、无间隙的八倍体基因组,并对该品种亚基因组之间 DNA 甲基化的变化进行分析。该课题组先将红颜草莓的 4 个亚基因组,与现有的二倍体基因组的全基因...
研究人员采用最近开发的方法,直接将来自73个栽培草莓样本的重测序序列分别比对到由5个二倍体草莓重构的参考基因组序列,确认森林草莓和饭沼草莓是八倍体草莓的二倍体祖先,而绿色草莓、黄毛草莓和西藏草莓则不是二倍体祖先。该研究策略无需基于系统发育关系,因而可有效避免基因渐渗和不完全谱系分选所带来的影响,研究...
此外,对于八倍体草莓在驯化过程中的亚基因组的同源偏向性表达及转变模式并不明确。
在此基础上,研究团队还采用不同的分析方法,重新追溯了八倍体草莓的二倍体祖先,纠正了国外学者在亚基因组分配上错误;并进一步确定,森林草莓和饭沼草莓是八倍体草莓现存的二倍体祖先种。 此项研究还探讨了八倍体草莓在驯化过程中的同源偏向性表达分化,并基于空间四联体方法,完成了八倍体草莓的静态和动态的同源偏向...
总的来看,该项研究为八倍体草莓的亚基因组结构、分化和表观遗传动力学的进化模式,提供了有价值的见解,有助于推动草莓遗传学和育种等方面的研究。 参考资料: 1.Y., Song, Y., Peng, L., Liu. et al. Phased gap-free genome assembly of octoploid cultivated strawberry illustrates the genetic and epige...
如何成功培育八倍体草莓 2023年07月08日 一、选用适合的品种 八倍体草莓主要是通过体细胞无性繁殖来培育的,因此选用良好的母本材料是很重要的。大多数八倍体草莓都是用Fragaria vesca L.作为母本材料进行培育的。 二、种植方法 八倍体草莓也可以采用普通草莓的种植方法进行栽培,在土壤中进行生长。在种...
20日,记者从中国农业科学院获悉,该院郑州果树研究所草莓种质改良团队联合深圳农业基因组研究所共同发布八倍体草莓端粒到端粒基因组,系统解析了八倍体草莓亚基因组结构和遗传分化,并解析了亚基因组的表观遗传进化机制。相关成果日前发表于国际期刊《园艺研究》。
现代栽培种草莓是两个野生八倍体草莓杂交后的产物,而这两种野生草莓又都是由四个二倍体祖先在一百多万年前融合而来。来自密歇根州立大学的Patrick P. Edger 团队联合加州大学戴维斯分校的研究人员报道了栽培种八倍体草莓(Fragaria×ananassa)染色体级别的基因组组装结果,揭示了八倍体草莓的起源和演化历程。研究在八...
现代栽培草莓(Fragaria × ananassa)是18世纪中期在法国由来自北美的八倍体弗吉尼亚草莓(F. virginiana)和来自南美的八倍体智利草莓(F. chiloensis)偶然杂交而成的异源八倍体。目前已成为全球广为栽培的水果。然而,对于其二倍体祖先的争论持续半个多世纪,至今未解决...
一、八倍体草莓的基因组结构 八倍体草莓是指草莓的基因组中含有八套等位基因,这是通过多倍体育种得到的。与二倍体草莓相比,八倍体草莓的基因组结构更为复杂,包含四个亚基因组(A、B、C和D),其中亚基因组A占据主导地位,而其他三个亚基因组则表现...