基因组光学图谱技术(Optical Genome Mapping, OGM)是一种高分辨率的基因组分析方法,通过直接对大分子DNA进行荧光标记,实现DNA分子的光学成像。以下是关于OGM的详细介绍:1️⃣ 基本概念 📚 OGM是一种构建全基因限制性内切酶图谱的高分辨率方法,利用基因组中的特定序位点进行荧光标记。2️⃣ 基本特点 🌟 高分...
光学图谱可更好的保持低覆盖NGS数据的序列顺序。实验显示光学图谱结合50x NGS拼接的基因组甚至比单独的80x NGS效果好。利用光学图谱数据修正NGS后得到更加可靠的拼接结果。光学图谱越来越多的与三代测序结合,被认为是目前de novo基因组的最佳组合,包括暨南大学发...
Bionano光学图谱技术，一次上机，可以得到超高深度数据，深入挖掘低频SV，轻松研究肿瘤异质性。同时，Bionano可用于检测环状DNA(ecDNA)和染色体碎裂等检测。样本类型：肿瘤样本或成对样本，手术或活检样本均可；原位癌及转移癌样本，手术或活检样本均可；PDX小鼠；细胞系样本，新鲜培养液或冷冻细胞沉淀；数据收集及分析方案...
利用DNA分子上CTTAAG的位置信息,Bionano自带分析软件会将单独的分子组装成超长的基因组组装图谱。组装的图谱最大可到百兆碱基。 原始图像转换和基因组图谱组装 组装好光学图谱后,根据不同的应用软件可进行后续结构变异检测(SV detection),体细胞结构变异分析(Rare Variant Pipeline), FSHD变异检测以及基因组混合组装(Hybri...
Bionano 全基因组光学图谱技术 与染色体核型类似，OGM也是将DNA标记染色后在显微镜下直接观察。不同的是OGM将染色拉直后的DNA分子在单分子高分辨荧光显微镜下进行拍照；同时采用序列特异的荧光转移酶进行标记，人类全基因组范围内可标记位点约500,000个。因此能够将结构变异的分辨率从上兆碱基提高到几百碱基。整个OGM技术...
基因组光学图谱技术(optical genome mapping,OGM),是一种高分率构建全基因组限制性内切酶图谱的方法,因为其高分辨率和长度长的检测特性,又被称下一代细胞遗传学技术,近年来随着研究的不断深入,OGM已在遗传病检测领域初露锋芒。接下来小...
Bionano光学图谱技术,一次上机,可以得到超高深度数据,深入挖掘低频SV,轻松研究肿瘤异质性。 同时,Bionano可用于检测环状DNA(ecDNA)和染色体碎裂等检测。 样本类型:肿瘤样本或成对样本,手术或活检样本均可;原位癌及转移癌样本,手术或活检样本均可;PDX小鼠;细胞系样本,新鲜培养液或冷冻细胞沉淀; ...
近日,美吉生物正式订购OpGen全基因组光学图谱系统,在上海建立基因组测序拼接平台和光学图谱服务中心。旨在为广大科研工作者提供更完整、可靠与精确的物种基因组拼接服务。 OpGen全基因组图谱技术利用微流体芯片技术能够自动化、高通量的对单个DNA分子生成限制性内切酶酶切位点物理图谱。科研人员能利用该图谱,结合第二代测...
Bionano光学图谱用于诊断皮肤科罕见病 4月8日，一篇 基因结构变异引起的皮肤遗传病发表在JID Innovations。文章做了两个家系的基因检测，一个荷兰家系通过全外显子测序找到12bp的剪接位点缺失，一个加拿大家系通过Bionano全基因光学图谱以及全基因组测序找到全外显子检测未发现的 缺失和倒位的结构变异。巴桑综合征 巴桑...