z-score的标准化究竟怎么弄? 在学习「数据挖掘导论」的数据预处理时,里面谈到了变量变换,我联想到了在基因表达量分析时的常见操作,例如FPKM,TPM,CPM,log对数变换。比如说在文章里面会见到如下的描述 The size factor of each cell was computed using a pooling strategy implemented in the R functioncomputeSumFac...
**Z值(z-score)**又称标准数,能够将不同量级的数据转化为相同量级,实现标准化。 其公式表示为: z=(x−μ)σ 其中:x为实际测量值,μ为平均数,σ为标准差。 Z-score后的值本身没有实际意义,仅使数据标准统一化。实测值>平均值,则z为正值,实测值<平均值,则z为负值。 在R中实现计算z-score R语言...
cufflinks生成tpm怎么计算出fpkm fpkm转tpm 1.问题提出在RNA-Seq的分析中,对基因或转录本的read counts数目进行标准化(normalization)是一个极其重要的步骤,因为落在一个基因区域内的read counts数目取决于基因长度和测序深度。很容易理解,一个基因越长,测序深度越高,落在其内部的read counts数目就会相对越多。当我...
z-score的标准化究竟怎么弄? 在学习「数据挖掘导论」的数据预处理时,里面谈到了变量变换,我联想到了在基因表达量分析时的常见操作,例如FPKM,TPM,CPM,log对数变换。比如说在文章里面会见到如下的描述 The size factor of each cell was computed using a pooling strategy implemented in the R functioncomputeSumFac...