在sratoolkit.3.1.1-win64\bin文件夹下创建sratest文件夹，放入6个SRA格式测试文件即可，其是基于Linu...
1.从ncbi下载sratoolkit工具,打开ncbi,到这个界面根据系统下载需要的sratoolkit,Windows 64位,于是就是下载倒数第二个。 2. 下载速度挺快的,之后得到一个压缩包,我们可以解压到指定的盘。 3.这个时候还不能直接用sratoolkit软件,还需要对电脑进行配置。 右击“此电脑”选择属性,选择“高级系统设置”——“高级”—...
1、下载SRA Toolkit并解压 进入NCBI的主页,在中间位置找到Download,点击进去后点击右下角的“Download Tools”,中间位置就是我们所需要的SRA Toolkit,点击Download或者用下面链接直达目的地: https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/01.-Downloading-SRA-Toolkit 可以看到有好多个版本,Windows系统选择MS Windows 64...
然后通过fastq-dump将这些数据转换成FASTQ文件,即可。 D:\1系统软件安装包\sratoolkit.2.11.0-win64\bin\fastq-dump -I --split-files SRRxxxxx 欧了。
view=software https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.11.0/sratoolkit.2.11.0-win64.zip 安装,解压即可 配置 添加环境变量 Path bin\prefetch.exe 序列号 bin\prefetch.exe 1. 2. bin\prefetch.exe --option-file C:\SRR_Acc_List.txt 1....
首先:下载最新sratoolkit安装包并解压(看文件结构感觉跟Blast的运行方式一致,如果有相关经验的同学就可以忽略不计了)。 其次:使用windows徽标键(好像是这么叫)+R,输入CMD,cd /d进入解压后的目录。 1563886072605.png 再次:cd进入\bin文件夹: 最后:检查安装是否正常(操作如上),当然在这一步也可将bin文件夹中的pre...
造成我在linux环境下不能使用aspera下载,只好在Windows下,下载了再上传到linux服务器。 一、工具下载 1.从ncbi下载sratoolkit工具,打开ncbi.aspera下载,只好在Windows下,下载了再上传到linux服务器。 一、工具下载 1.从ncbi下载sratoolkit工具,打开ncbi,到这个界面根据系统下载你...
在NCBI推荐的小工具中,小编选择使用SRA Toolkit。该方法分为以下几个步骤: 1、下载SRA Toolkit并解压 进入NCBI的主页,在中间位置找到Download,点击进去后点击右下角的“Download Tools”,中间位置就是我们所需要的SRA Toolkit,点击Download或者用下面链接直达目的地: ...
在NCBI推荐的小工具中,小编选择使用SRA Toolkit。该方法分为以下几个步骤: 1、下载SRA Toolkit并解压 进入NCBI的主页,在中间位置找到Download,点击进去后点击右下角的“Download Tools”,中间位置就是我们所需要的SRA Toolkit,点击Download或者用下面链接直达目的地: ...