全基因组甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)是通过 Bisulfite处理将基因组中未发生甲基化的C碱基进行转换用以区分具有甲基化修饰的C碱基,并结合高通量测序技术判断CpG/CHG/CHH位点是否发生甲基化的一种方法。 基于重亚硫酸盐的甲基化分析方法,首先通过重亚硫酸盐对样本DNA进行处理,将未甲基化的C碱基...
WGBS技术的原理和流程可分为以下几个步骤：1. 将DNA样本经过亚硫酸盐处理，将非甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶（Uracil），而甲基化的胞嘧啶则保持不变。2. 将经过处理的DNA进行PCR扩增，此时尿嘧啶会变为胸腺嘧啶（Thymine），与原本甲基化的胞嘧啶（Cytosine）区分开。3. 通过高通量测序技术对PCR产物进行测序，可以...
关于易基因全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)技术 全基因组重亚硫酸盐甲基化测序(WGBS)可以在全基因组范围内精确的检测所有单个胞嘧啶碱基(C碱基)的甲基化水平,是DNA甲基化研究的金标准。WGBS能为基因组DNA甲基化时空特异性修饰的研究提供重要技术支持,能广泛应用在个体发育、衰老和疾病等生命过程的机制研究中,也是各物...
全基因组重亚硫酸盐甲基化测序（WGBS）可以在全基因组范围内精确的检测所有单个胞嘧啶碱基（C碱基）的甲基化水平，是DNA甲基化研究的金标准。WGBS能为基因组DNA甲基化时空特异性修饰的研究提供重要技术支持，能广泛应用在个体发育、衰老和疾病等生命过程的机制研究中，也是各物种甲基化图谱研究的首选方法。全基因组甲基...
WGBS测序 介绍 WGBS(Whole Genome Bisulfite Sequencing),全基因组DNA甲基化测序被视为DNA甲基化研究的“金标准”,通过重亚硫酸盐(Bisulfite)处理样本DNA,将未甲基化的C碱基转化为U碱基,而甲基化的C碱基则不会改变。在PCR扩增后,U碱基会变成T,与原本甲基化的C碱基区分开,再结合高通量测序技术,可绘制单碱基分辨率...
Tn5 Transposase(Tn5转座酶):Tn5转座酶在开放的染色质区域插入,其携带测序接头(adapters),这使得这些区域的DNA片段可以被后续的测序步骤识别和扩增。 Amplifiable Fragments(可扩增的片段):转座酶在开放染色质区域插入接头后,这些区域的DNA片段被剪切并连接上测序接头,从而形成可供扩增和测序的片段。
它不仅影响基因的表达,还在细胞分化、发育和疾病发生中发挥着关键作用。全基因组甲基化测序(WGBS)作为甲基化研究的“金标准”,能够在单碱基水平上全面分析整个基因组的甲基化状态,这项技术因其高精度和全面覆盖,成为众多高影响力研究和高水平学术论文的首选测序方法,长期以来也备受国自然的青睐。
测序方式:亚硫酸氢盐转化后对细胞游离DNA(cfDNA)进行高通量测序 研究结果 01 甲基化标志物具有细胞、组织和器官类型特异性 研究者对从肾移植受者队列(图1B)收集的51个尿液cfDNA分离物进行全基因组甲基化测序(WGBS)(图1A),并使用计算方法量化病...
图1:通过全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)鉴定和表征衰老肝脏中的差异甲基化区域(DMR)。 根据三个基线年龄组(A2R0、A8R0和A16R0)的DNA甲基化水平对CpG频率(frequency)分类直方图,其中X轴显示DNA甲基化水平(从0到100%),Y轴显示CpG事件频率。每个图表表示4个生物学重复的平均值。
在表观研究领域,有两大经典测序产品经久不衰,一直是广大科研工作者的发文利器,即染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)和全基因组甲基化测序(WGBS)。这两种常用的高通量测序技术,在分子生物学和遗传学研究中有着广泛的应用领域,包括疾病的发生发展、胚胎发育、癌症研究和动植物性状研究等。