本文介绍的通过Multiwfn的定量分子表面分析功能结合VMD和Photoshop作分子表面静电势图步骤相对步骤较多,但是优点十分显著,就是可以在分子表面上显示出静电势极值点位置,可以十分灵活地调节显示效果,而且还可以通过相同的方法绘制出分子表面上静电势以外的实空间函数的分布,比如平均局部离子化能、局部电子亲和能、Fukui函数等等...
1.Multiwfn+VMD,在入门手册中都可以找到 (1) Lu, T.; Chen, F., Multiwfn: a Multifunctional Wavefunction Analyzer. J. Comput. Chem. 2012, 33, 580-592.(2) Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K., VMD: Vis…
第二种是类似《基于Multiwfn产生的cube文件在VMD和GaussView中绘制填色等值面图的方法》(http://sobereva.com/402)文中的做法,用Multiwfn产生电子密度和静电势的cube文件,载入到VMD里,将静电势的数据以不同颜色映射到电子密度的等值面上。本文说的范德华表面是指Bader的定义,即把电子密度0.001 a.u.等值面作为范德...
教你用Multiwfn 结合 VMD 高效绘制 1334 4 05:08 App 计算HOMO和LUMO轨道环境搭建及参数讲解-粗中带细 1609 4 14:53 App 用Origin绘制各组分HOMO和LUMO能级对比图详细过程 2.0万 2 03:57 App Multiwfn+VMD绘制比较高级的HOMO/LUMO轨道 浏览方式(推荐使用) 哔哩哔哩 你感兴趣的视频都在B站 打开...
Using Multiwfn and VMD to calculate molecular surface area and fragment surface area 文/Sobereva@...
大家在运用Multiwfn+VMD绘制HOMO和LUMO轨道图的时候,如果存在问题,仔细检查一下前面步骤中的参数,如果还不行,按照之前的视频可以重新安装一下Multiwfn+VMD软件。, 视频播放量 2148、弹幕量 0、点赞数 30、投硬币枚数 16、收藏人数 100、转发人数 11, 视频作者 贱小贱022
在VMD中作图打开VMD,然后把furan.pdb和vtx.pdb按顺序依次拖动到VMD Main窗口下,ID分别是0、1。把Display-Depth Cueing将它关掉,否则图像不够清晰。 选择Graphics-Colors,在Color Definitions界面选择Display-B…
更改了Multiwfn中showorb.txt中的第三行，双击showorb.bat ，但在双击过后打不开VMD，是一个忽闪一...
本文介绍的通过Multiwfn的定量分子表面分析功能结合VMD和photoshop作分子表面静电势图既不比使用Gaussview快,步骤也比它复杂,但是优点十分显著,就是可以在分子表面上显示出静电势极值点位置,可以十分灵活地调节显示效果,而且还可以通过相同的方法绘制出分子表面上静电势以外的实空间函数的分布,比如平均局部离子化能、局部...
会员专区 游戏 快捷访问 历史 创作 客户端 00:00 00:00 倍速 收藏 分享 手机看 侵权/举报Multiwfn+VMD绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图 2020年5月15日发布 07:27 Multiwfn+VMD绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图