将图层2的不透明度改为40%,这样分子结构就会显示为半透明。 裁剪掉多余的部分,ps窗口里的图像目前如下所示。蓝色的区域静电势为负值,红色的区域静电势为正值,白色的区域静电势约为0。 往期回顾 使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布(上) 干货丨Materials Studio搜索过渡态(二) 干货丨Materials Studio搜索...
本文介绍的通过Multiwfn的定量分子表面分析功能结合VMD和photoshop作分子表面静电势图既不比使用Gaussview快,步骤也比它复杂,但是优点十分显著,就是可以在分子表面上显示出静电势极值点位置,可以十分灵活地调节显示效果,而且还可以通过相同的方法绘制出分子表面上静电势以外的实空间函数的分布,比如平均局部离子化能、局部...
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子 表面静电势分布 文/Sobereva2013-Jul-28 1前言 分子表面静电势图经常在文献中出现,不同 表面区域静电势大小通过不同颜色展现,使 分子表面上静电势的分布一目了然。分子表 面一般都用Bader定义的范德华表面,即 电子密度为0.001e/Bohr^3的等值面。
本文介绍的通过Multiwfn的定量分子表面分析功能结合VMD和Photoshop作分子表面静电势图步骤相对步骤较多,但是优点十分显著,就是可以在分子表面上显示出静电势极值点位置,可以十分灵活地调节显示效果,而且还可以通过相同的方法绘制出分子表面上静电势以外的实空间函数的分布,比如平均局部离子化能、局部电子亲和能、Fukui函数等等...
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布 http://sobereva.com/196 然后以相同步骤，计算并在VMD...
使用的Multiwfn是最新3.8版，VMD是1.9.3版。在按照“使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布...
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布文Sobereva2013Jul281前言分子表面静电势图经常在文献中出现,不同表面区域静电势大小通过不同颜色展现,使分子表面上静电势的分布一目了然,分子表面一般都用Bader定义
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布 文/Sobereva 2013-Jul-28 1 前言 分子表面静电势图经常在文献中出现,不同表面区域静电势大小通过不同颜色展现,使分子表面上静电势的分布一目了然。分子表面一般都用Bader定义的范德华表面, e/Bohr^3的等值面。只要提供所需的输入数据,这种图在许多程序中都可以作...
在控制台输入mol modstyle 0 1 VDW 0.06 ，请问控制台在哪里？谢谢
使用Multiwfn结合VMD分析和绘制分子表面静电势分布 文 Sobereva2013 Jul 28 1 前言 分子表面静电势图经常在文献中出现 不同表面区域静电势大小通过不同颜色展现 使分子表面上静电势的分布一目了然 分子表面一般都用B,人人文库,