用conda安装python 用conda安装vcftools VCFtools安装和简单试用 日期:2022-1-21 1. 下载安装VCFtools 在官网(https://vcftools.github.io/index.html)下载VCFtools安装包,下载地址链接为https://vcftools.github.io/downloads.html,该网页内界面如下所示,方框内为下载按钮。如果点击的是View On GitHub需要进入release...
但是vcftools安装确实容易出现各种报错,所以建议用conda来安装: $ conda install-c bioconda vcftools 2. 基础用法 2.1 vcf文件加ID add id.pl拷贝至vcftools/bin目录下 add id.pl是一个老师写的脚本,这里不好直接放上来,所以需要添加id的话,请大家再去查找其他的教程,这里只是我自己做个备份。 perl add_id.pl...
这里,介绍第一篇:vcftools的安装。(当然,最简单的方法是conda安装,这里介绍一下源码编译安装) 1. 下载 https://vcftools.github.io/examples.html 下载到本地,上传到 2. 解压缩 代码语言:javascript 复制 unzip vcftools-vcftools-v0.1.16-18-g581c231.zip cd vcftools-vcftools-581c231/ 3. 安装 代码语言:...
2. conda安装 代码解读 conda install -c bioconda vcftools 1. 搞定
这里,介绍第一篇:vcftools的安装。(当然,最简单的方法是conda安装,这里介绍一下源码编译安装) 1. 下载 https://vcftools./examples.html 下载到本地,上传到服务器中。 2. 解压缩 unzip vcftools-vcftools-v0.1.16-18-g581c231.zip cdvcftools-vcftools-581c231/ ...
这里,介绍第一篇:vcftools的安装。(当然,最简单的方法是conda安装,这里介绍一下源码编译安装) 1. 下载 https://vcftools.github.io/examples.html 下载到本地,上传到服务器中。 2. 解压缩 unzipvcftools-vcftools-v0.1.16-18-g581c231.zip cdvcftools-vcftools-581c231/ ...
一、安装 conda install -c bioconda vcftools 二、功能概览 常用功能如下,待具体用到时再做详细补充: Get basic file statistics Applying a filter Writing to a new VCF file Converting a VCF file to BCF Getting allele frequency Getting sequencing depth information ...
这里,介绍第一篇:vcftools的安装。(当然,最简单的方法是conda安装,这里介绍一下源码编译安装) 1. 下载 https://vcftools.github.io/examples.html 下载到本地,上传到服务器中。 2. 解压缩 unzip vcftools-vcftools-v0.1.16-18-g581c231.zip cdvcftools-vcftools-581c231/ ...
用conda安装python 用conda安装vcftools VCFtools安装和简单试用日期:2022-1-211. 下载安装VCFtools在官网(https://vcftools.github.io/index.html)下载VCFtools安装包,下载地址链接为https://vcftools.github.io/downloads.html,该网页内界面如下所示,方框内为下载按钮。如果点击的是View On GitHub需要进入release中寻 ...
from bcf_entry.h:10, from bcf_entry.cpp:9: bgzf.h:33:10: fatal error: zlib.h: No such file or directory #include <zlib.h> 1. 2. 3. 4. 5. 6. 还是用conda安装吧: 2. conda安装 conda install -c bioconda vcftools 1. 搞定...