VTST Scripts: vtstscripts.tar.gz 找到 main.F Find and replace:CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,...
我们用VTST中CI-NEB做示范,(首先要确保编译VASP的时候安装了VTST,否则用的是VASP自带的NEB,非常糟糕)。 步骤一:优化初态和末态结构。FCC位和HCP位。 步骤二:用dist.pl(VTST脚本)检查两个优化后结构(两个CONTCAR)的相似程度(每个对应原子的初末态距离的平方和,再开根号)。 1 dist.pl ini/CONTCAR fin/CONTCAR...
(3)安装-VASP过渡状态工具 --- Installation — Transition State Tools for VASP(这是官网教程) 二编: 这是我忘记的一些步骤,今天重新装又是痛苦的查找资料才成功,所以给大家再次编辑一下。 如果想用neb等功能,需要下载后续的工具包到program中,也就是vtst所在目录 解压 cdprogram tar -zxvf vtstscripts.tgz ...
二. 命令行提交 通过SSH连接创建并连接管理节点。 Step 1. 创建作业目录并进入; mkdirvaspJob1 cdvaspJob1 Step 2. 通过文件传输上传所需的输入文件,详情请查看Linux数据传输; Step 3. 在该文件夹下创建如下执行脚本vasp.sh: #!/bin/bash moduleaddvasp/6.3.0+VTST+vtstscripts ulimit-s unlimited ulimit...
1) 在VTST官网上下载vtstcode以及vtstscripts文件夹 （http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/...
如何加入Vasp TST Tools,vtstcode按照说明加入,但是vtstscripts怎么用起来? 第一性原理 Vasp&MedeA 第115896页 小木虫 论坛
我用的版本是vasp6.3.0，vtstcode-184，自己组centOS7环境服务器和南大超算都顺利编译并正常使用。安装...
将export PATH=/your script path/:${PATH}和export PATH=/your script path/vtstscripts:${PATH}添加到~/.bashrc文件并保存。计算步骤如下：结构优化 (NSW≠0)。复制结构优化完的结构文件CONTCAR为静态计算的结构文件POSCAR。自洽计算 (IBRION=-1,NSW=0)。INCAR中要增加LCHARG = .TRUE.以输出电荷...
其编译过程非常简单,可参官网编译说明或参考本号往期文章:VASP.6.XX编译VTST版本示例。这种NEB的优点是,最高能量的图像将收敛到鞍点。此外,在VTSTTools包中还有一些更有效的用于收敛NEB计算的优化器,以及对应的VTST scripts pl程序脚本,该脚本包包含动态查看NEB计算过程中的能量和力的收敛情况,NEB数据处理,同时还有...
tar –xvzf vtstscripts.tgz 将生成的 vtstscripts-940 文件夹移动到 /home/vasp.5.4.4/ 中 添加环境变量 打开.bashrc ,在其末尾添加 export PATH=/home/cyh/vasp.5.4.4/bin:$PATHexport PATH=/home/cyh/vasp.5.4.4/vtstscripts-940:$PATH 退出并保存 .bashrc 。再使其生效 ...