https://github.com/QijingZheng/pyband/blob/master/nose_mass.py 使用一个含有64个硅原子的体系做测试,(https://github.com/tamaswells/VASP_script/tree/master/SMASS) 程序需要读取POSCAR获得晶格矢量x的长度以及系统的自由度,运行方式为:python nose_mass.py -i POSCAR -u fs -T 1800 -f 40 其中-u ...
SMASS，TEBEG，TEEND，POMASS，NBLOCK，KBLOCK，PSTRESS –离⼦弛豫收敛标准：EDIFFG ●定义态密度积分的⽅法和参数 –smearing⽅法和参数：ISMEAR，SIGMA –计算态密度时能量范围和点数：EMIN，EMAX，NEDOS –计算分波态密度的参数：RWIGS，LORBIT ●其它 –计算精度控制：PREC –磁性计算：ISPIN，MAGMOM，...
-1:原子位置不移动 0:标准的分子动力学模拟。采用Verlet算法来积分原子的牛顿运动方程.通过POTIM来控制时间步长(单位是fs).SMASS控制系综的设置 1:采用准牛顿算法来优化原子的位置 2:采用共轭梯度算法来优化原子的位置 3:采用最速下降算法来优化原子的位置 5:用来计算Hessian矩阵和体系的振动频率 NFREE:相当于设置...
这是因为根据对截断能量的选取不同还可以分为Ga,Ga_s,Ga_h，或者根据半芯态的不同还可以分为Ga,Ga...
16.SMASS:确定分子动力学中原子的速度,默认值为-3。 -3:微正则系综(总的自由能守恒) -2:保持初始速度不变,计算体系总能随原子位置的变化情况 -1:在每NBLOCK步之后对初始速度进行放缩 0或者>0,正则系统,对温度进行Nose调控 TEBEG:分子动力学模拟时的初始温度,默认为0。
- 分子动力学相关参数：SMASS，TEBEG，TEEND，POMASS，NBLOCK，KBLOCK，PSTRESS - 离子弛豫收敛标准：EDIFFG ● 定义态密度积分的方法和参数 - smearing方法和参数：ISMEAR，SIGMA - 计算态密度时能量范围和点数：EMIN，EMAX，NEDOS - 计算分波态密度的参数：RWIGS，LORBIT ● 其它 - 计算精度控制：...
SMASS控制系综的设置 1:采用准牛顿算法来优化原子的位置 2:采用共轭梯度算法来优化原子的位置 3:采用最速下降算法来优化原子的位置 5:用来计算Hessian矩阵和体系的振动频率 NFREE:相当于设置的自由度。当IBRION=5,NFREE=2或4决定了原子的移动,推荐设置为2。 POTIM:当IBRION= 1, 2或3时,是力的一个缩放常数(...
LCHARG=F：尽量避免计算电荷密度，以减小CHG文件大小。TEBEG=300：初始温度。TEEND=300：终态温度，未设置时默认等于TEBEG。SMASS：用于NVE、NVT或模拟退火的参数，根据需要选择。这些参数的设置旨在优化模拟过程，确保模拟结果的准确性和效率。对于不同类型的模拟任务，可以根据具体需求调整这些参数。
SMASS:控制从头MD中的速度。取值:- 3~0,缺省值:- 3 微正则系综(总自由能 不变),- 2 保持初速度不变,- 1 每NBLOCK步调整速度,来保证动能连续,>=0 Nosé 算法模拟正则系综NPACO:成对相关函数的槽数。取值:整数,缺省值:256APACO:成对相关函数求值中的最大距离(?)。取值:整数,缺省值:16...
1. 切换成Nose-hoover恒温器，即MDALGO = 2。SMASS才有意义。2. 使用Anderson恒温器，没有设置...