https://github.com/QijingZheng/pyband/blob/master/nose_mass.py 使用一个含有64个硅原子的体系做测试,(https://github.com/tamaswells/VASP_script/tree/master/SMASS) 程序需要读取POSCAR获得晶格矢量x的长度以及系统的自由度,运行方式为:python nose_mass.py -i POSCAR -u fs -T 1800 -f 40 其中-u ...
如果SMASS=—1,它将控制原子的动能在每多少步后进行缩放。 KBLOCK:默认值为NSW。每KBLOCK*NBLOCK步后,将输出对关联函数和态密度。 IBRION:决定了原子如何移动或迟豫。如果NSW=0或1,则默认值为-1,否则为0。可赋予值为-1|0|1 | 2|3 | 5。IBRION=0表示进行分子动力学模拟。为-1表示原子不移动。为其他...
正确: SMASS=1,2,3是没有区别的。都是 NVT ensemble。SMASS要是大于 0 就是 NVT系综。CONTCAR 每个离子步之后都会写出来的,但是会用新的把老的覆盖CHG是在每10个离子步写一次,不会覆盖 CHGCARi在任务 正常结束之后才写的。5、收敛判据的选择结构弛豫的判据一般有两中选择:能量和力。这两者是相关的 18、...
这是因为根据对截断能量的选取不同还可以分为Ga,Ga_s,Ga_h，或者根据半芯态的不同还可以分为Ga,Ga...
SMASS，TEBEG，TEEND，POMASS，NBLOCK，KBLOCK，PSTRESS –离⼦弛豫收敛标准：EDIFFG ●定义态密度积分的⽅法和参数 –smearing⽅法和参数：ISMEAR，SIGMA –计算态密度时能量范围和点数：EMIN，EMAX，NEDOS –计算分波态密度的参数：RWIGS，LORBIT ●其它 –计算精度控制：PREC –磁性计算：ISPIN，MAGMOM，...
POTIM：IBRION=0时，给出MD每步步长；IBRION=1~3时，给出最小化的度量常量。 NSW：给出最大离子步数，取值为整数。 EDIFFG：指定离子弛豫循环的中断条件，用于控制核运动的收敛精度。 SMASS：控制从头MD中的速度。 TEBEG, TEEND：控制从头分子动力学计算中的起始温度和最终温度。 POMASS：与分子动力...
SMASS = -3 # -3 NVE ensemble, -1模拟退火 . >0 NVT ensemblePOTIM = 2.0 #时间步长。一般1 到 3. 这个最好跑一下NVE 系综,看一下总能是否守恒。ISMEAR = -1; SIGMA = 0.1 # -1是电子费米达拉克占据,主要用来处理电子含温。LREAL = AISIF = 2 #就算压力。NPACO = 200,APACO = 10 #计算...
-1：原子位置不移动0:标准的分子动力学模拟。采用Verlet算法来积分原子的牛顿运动方程。通过POTIM来控制时间步长(单位是fs)。SMASS控制系综的设置1:采用准牛顿算法来优化原子的位置2:采用共轭梯度算法来优化原子的位置3:采用最速下降算法来优化原子的位置5:用来计算Hessian矩阵和体系的振动频率...
还有就是如果仅仅是跑分子动力学稳定性验证的时候是不是smass=0就可以，我您也说到了这个smass取值的...
SMASS控制系综的设置 1:采用准牛顿算法来优化原子的位置 2:采用共轭梯度算法来优化原子的位置 3:采用最速下降算法来优化原子的位置 5:用来计算Hessian矩阵和体系的振动频率 NFREE:相当于设置的自由度。当IBRION=5,NFREE=2或4决定了原子的移动,推荐设置为2。 POTIM:当IBRION= 1, 2或3时,是力的一个缩放常数(...