最后的N表示插点数目。插入点的算法为线性插值,详情请进前面给的vtst脚本链接。我这里设置N为3,执行完命令后出现文件夹00,01,02,03,04.五个文件夹里面都有nebmake.pl产生的POSCAR。 00表示初态,里面放的是ini/CONTCAR, 04表示末态,放的是fin/CONTCAR, 01、02、03是插入的过渡结构。 输出中提示讲初末态对...
(1)VASP6.3.2中VTST插件的编译_vtst编译-CSDN博客 (2)VASP6.3.2 + vtstcode6.3编译出错 - 第一性原理 (First Principle) - 计算化学公社 (3)安装-VASP过渡状态工具 --- Installation — Transition State Tools for VASP(这是官网教程) 二编: 这是我忘记的一些步骤,今天重新装又是痛苦的查找资料才成功,所...
CI-NEB过渡态计算步骤,练习一:O在Au(111)上的迁移 我们用VTST中CI-NEB做示范,(首先要确保编译VASP的时候安装了VTST,否则用的是VASP自带的NEB,非常糟糕)。 步骤一:优化初态和末态结构。FCC位和HCP位。 步骤二:用dist.pl(VTST脚本)检查两个优...
LCLIMB=.TRUE. #通知VASP使用vtst计算; ICAHIN=0 #通知VASP使用vtst计算; IMAGES=7 #之前添加的图像数量N image number; IBRION =3 #specify that VASP does molecular dynamics; POTIM=0 #zero time step so that VASP does not move the ions; 这里其实是抛弃VASP自带的优化,选用vtst的优化方法; IOPT=1 ...
我们用VTST中CI-NEB做示范,(首先要确保编译VASP的时候安装了VTST,否则用的是VASP自带的NEB,非常糟糕)。 步骤一:优化初态和末态结构。FCC位和HCP位。 步骤二:用dist.pl(VTST脚本)检查两个优化后结构(两个CONTCAR)的相似程度(每个对应原子的初末态距离的平方和,再开根号)。
在VASP-vtst计算平台中，NEB优化算法通过特定的参数设置（如IOPT参数）实现。vtst脚本包为用户提供了Perl语言编写的工具，例如dist.pl、nebmake.pl等，用于辅助NEB计算的各个步骤，包括结构优化、插点生成等。计算过程分为以下几个步骤：1. 结构优化：分别对初始态和最终态进行结构优化，确保两个优化后的...
前往VTST的官方网站或可信的软件仓库下载VTST软件包,例如vtstcode-197.tgz。 解压VTST软件包到适当目录: 将下载的VTST软件包解压到与VASP相同的目录中。例如: bash tar -zxvf vtstcode-197.tgz 配置VTST与VASP的接口: 进入VASP的源代码目录(如vasp.6.3.2/src)。 根据VASP的版本和VTST的要求,修改VASP的源代...
我在并行超算平台编译好了 VASP-vtst，计算频率等任务均能正常完成，但在Dimer法寻找过渡态时，无法正常...
1.http://henkelmanlab.org/vtsttool ... vtst-code-into-vasp 2.http://hmli.ustc.edu.cn/doc...
将vtstcode-178 文件夹目录下所有文件复制到 /home/vasp.5.4.4/src/ 中(替换 chain.F ) 打开并修改 src 文件夹中的 main.F ,将 CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,DYN%POSION,TOTEN,TIFOR, &LATT_CUR%A,LATT_CUR%B,IO%IU6) 替换为 CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,DYN%POSION,TOTEN,TIFOR, &TSIF...