另外补充Uniprot数据库下载家族成员 UniProt 是 Universal Protein 的英文缩写,是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。它由整合Swiss-Prot、 TrEMBL 和 PIR-PSD 三大数据库的数据而成。他的数据主要来自于基因组测序项目完成后,后续获得的蛋白质序列。它同时包含了大量来自文献的蛋白质的生物功能的信息。网址:uniprot...
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03跟着誉川学网药:Uniprot数据库中下载已经验证过的蛋白质的数据(包括其对应的基因名), 视频播放量 1271、弹幕量 1、点赞数 15、投硬币枚数 8、收藏人数 25、转发人数 6, 视频作者 红成笑, 作者简介 红成啦,笑笑啦~,相关视频:24.03再从UniPriot数据库中下载最新的靶
要从NCBI和Uniprot数据库下载已知家族成员,首先,访问ncbi.nlm.nih.gov,选择gene数据库。在搜索框中输入家族名称,如DNA (cytosine-5)-methyltransferase,确保关键词准确。推荐使用模式物种如水稻、拟南芥、果蝇等进行定向检索。例如,选择拟南芥,进入筛选页面后,点击Protein-coding,然后选择具体物种。以DME...
2、数据库下载 2.1、完整数据库下载 完整数据库下载示例如下:(数据库较大,可以用其他下载工具或本地下载后再上传服务器) wget -c ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/complete/uniprot_sprot.fasta.gz wget -c ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_relea...
一般蛋白质组搜库首选数据库也是UniProt,所以对于通过UniProt库搜库的组学数据,可以在此网站中进行蛋白功能查询。UniProt数据库可以提供的信息包括蛋白功能描述、GO条目、细胞定位、组织特异性表达情况、生理病理情况描述、互作蛋白、Domain、翻译后修饰位点等信息。蛋白的信息描述段落均会标出引用文章,并且可以跳转到PubMed...
可以尝试通过以下步骤从公共数据库(如UniProt)中查找和下载蛋白质组质谱数据: 打开UniProt 网站(https://www.uniprot.org/)并在搜索框中输入感兴趣的蛋白质名称或 UniProt ID。 在搜索结果页面中,选择目标蛋白质,并在其摘要信息页面中查看“Proteomics”一栏,以确定是否有可用的质谱数据。 如果有可用的质谱数据,则可...
1、断开网络连接重新连接。2、退出程序重新启动。3、版本更新后在重新下载。
Uniprot (Universal Protein )是包含蛋白质序列,功能信息,研究论文索引的蛋白质数据库,整合了包括EBI( European Bioinformatics Institute),SIB(the Swiss Institute of Bioinformatics),PIR(Protein Information Resource)三大数据库的资源。
1、退出uniprot程序重新启动。2、更新uniprot版本,重新下载。3、断开网络连接再重新连接。