英国生物银行(UK Biobank,UKB)是英国迄今以来规模最大的有关致病或预防疾病的基因和环境因子的信息资源库。目的是探求一些特定基因、生活方式和健康状况之间的关系,提高对一些遗传类疾病致病基因的理解,包括癌症、心脏病、糖尿病和一些特定的精神疾病。UK Biobank项目在2006-2010年间共收集英国各地年龄在40 - 69 ...
当地时间2023年11月30日,英国生物数据库UK Biobank公布了迄今为止世界上最大的全基因组序列(whole-genome sequence)数据集,包含近50万人的基因数据。这些数据将通过UK Biobank的云平台向全世界的申请者开放。“对于从事健康研究的科学家来说,这个数据库毫无疑问是一个宝库。我期待全球的研究者们可以通过它做出诊断...
研究者在申请 UK Biobank 研究数据和生物样本前,需在 UK Biobank 官方网站注册一个 Access Management System(AMS)账号。 登陆UK Biobank 官方网站(https://www.ukbiobank.ac.uk/),进入网站后选择「Research login」。 图片来源:网页截图 点击进入 UK Biobank 的「Research login」,即可进入可转至 UK Biobank Acc...
一、UK Biobank数据库与RAP平台的背景说明Research Analysis Platform(简称RAP,地址:http://ukbiobank.dnanexus.com/)是UKB与AMS和DNAne… 阅读全文 【CLI使用】UKB DNAnexus dxpy安装报错解决方案(Win11) 朱晨 中国农业大学 经济管理学院教授
在UKB官网(https://www.ukbiobank.ac.uk/)点击上部的”Researcher login“,再点击链接中的”Sign up to access UK Biobank resources“,输入相关信息,完成后会收到账号激活的邮件。注意,收到激活邮件后仍需要进一步填写研究人员相关信息、所使用的大学或机构邮箱地址、论文发表记录等,完成或会进入”Under review“阶...
朱晨:【UK Biobank干货】教你如何从RAP云计算平台下载数据64 赞同 · 200 评论文章 1、登录RAP系统,进入目标Project,点击进入Bulk文件夹,可以看到Brain MRI、Heart MRI、Whole Body DXA等影像数据均存放于此。 2、本教程以提取Brain MRI影像数据为例,依次点击Brain MRI--->dMRI,可以看到许多以数字命名的子文件夹...
英国生物银行(UK Biobank,简称UKB;官网:https://www.ukbiobank.ac.uk/)作为目前世界上最为知名和开放的生物银行,2006年-2010年收集了英国各地50万名参与者的样本。使用UKB数据的中国研究者数量已位居全球第三,仅次于英国和美国的研究人员数量。在临床疾病领域得到了越来越广泛的应用。赶紧挖掘这个数据库发高质量的...
英国生物银行(UK Biobank,UKB)是一个大型的生物医学数据库和研究资源,作为一项前瞻性的流行病学科学研究计划,共收集了英国各地年龄在 40~69 岁之间的 50 万例志愿者数据信息,包括了志愿者的基因数据、多模态影像数据及健康相关数据。这项研究计划的时间跨度从 2006 年延续至今,并且官方表示在未来 30 年内,将长期...
UKBiobank数据,能下哪些? 在使用UKBiobank数据时,有些数据是可以下载的,而有些数据则不能下载。以下是详细的说明: 不能下载的数据: Bulk内的所有数据 通过app开头的数据库链接文件提取的数据(如table-exporter或数据库接口提取的临床表型数据) 可以下载的数据: 通过原始数据分析得到的摘要级数据,例如cox回归结果和基...
这个文章,收录各种各样的UKBiobank的常见问题,不定时更新。 欢迎大家在评论区留言。 主要包含以下内容: 1.AMS账号注册、申请、登录、访问权限的常见问题 2.RAP平台绑定、使用、账单、扣费、工程或者数据组成等常见问题 3.其他常见问题,不涉及深度的数据分析教程 ...