今天学习下如何下载UKBiobank的数据并进行整理,把它变成TwoSampleMR能够使用的格式。 数据下载 打开ukbiobank的官网:https://www.nealelab.is/uk-biobank 打开后往下拉,找到results can be found here,点击它: 点击之后即可来到数据界面,首先是README这个sheet,这里会有一些介绍,每个文件包含哪些内容,每个文件的列名是...
🔑 数据传输的关键步骤: 从bulk文件夹使用命令行dx download将数据传进JupyterLab。 在JupyterLab中进行计算。 将计算结果传回UK Biobank,再从UK Biobank下载到本地电脑进行可视化或作图。📊 常见研究方法: 使用命令行dx download将数据传进JupyterLab。 在JupyterLab中进行计算。 将计算结果传回UK Biobank,再从UK...
Research Analysis Platform(简称RAP,地址:ukbiobank.dnanexus.com/)是UKB与AMS和DNAnexus合作推出的云计算平台,功能强大,是未来数据分析和计算的趋势。 【注意1】UKB影像数据下载使用前提:具备UKB Tier 3数据权限(9000英镑档)。 【注意2】UKB分配给每个所申请项目Project中的eid都是随机生成的,不同项目之间无法根据...
英国生物银行（UK Biobank）已发布了超过60000人的影像数据。本文介绍从Research Analysis Platform（RAP）系统直接下载原始影像数据的方法，适用于具备UKB Tier 3数据权限的用户。使用前提包括UK Biobank账号申请成功、Proposal申请成功、拥有AMS账号、数据使用费支付成功以及数据使用协议签署成功。注意：UKB影像数...
大家好,有小伙伴问Lee Lab处理的UK biobank的GWAS数据怎么寻找和下载,今天粗略讲一下。 首先,进入到官网,链接: https://www.leelabsg.org/resources。长这样: UK biobank的二分类GWAS数据(即疾病)点击链接…
对于申请并获批使用UK Biobank项目的研究人员，进入数据下载与利用阶段后，可以选择通过与AMS和DNAnexus合作建立的云计算平台Research Analysis Platform（简称RAP）获取所需数据。要充分利用RAP，请遵循以下指导步骤。准备工作 在开始之前，请确保满足以下条件：UK Biobank账号已成功申请，研究提案申请成功，已...
手把手教你下载UK biobank的GWAS数据SCI狂人团队 2023-09-21 发表于广东 该网站使用了框架技术,但是您的浏览器不支持框架,请升级您的浏览器以便正常访问。本站是提供个人知识管理的网络存储空间,所有内容均由用户发布,不代表本站观点。请注意甄别内容中的联系方式、诱导购买等信息,谨防诈骗。如发现有害或侵权内容,...
UK biobank中GWAS数据下载链接An**us 上传6.14MB 文件格式 xlsx excel UK biobank中GWAS数据下载链接 点赞(0) 踩踩(0) 反馈 所需:1 积分 电信网络下载 Screenshot_2024-04-17-16-48-47-174_com.chaoxing.mobile.jpg 2025-04-05 01:33:11 积分:1 遗憾- Love-Feel Sorry 2025-04-05 02:18:27 ...
首先,咱们得学会怎么从RAP平台提取数据。UKBiobank的数据资源丰富,但如何高效提取呢?这里有详细的教程,教你如何快速下载你需要的数据。 云RStudio的使用技巧 🌐 接下来,我们聊聊云RStudio。在RAP平台上,你可以使用云RStudio进行数据分析。这个工具非常强大,但也需要一些技巧。这里有一些使用云RStudio的小贴士,帮你更...
UKBiobank数据,能下哪些? 在使用UKBiobank数据时,有些数据是可以下载的,而有些数据则不能下载。以下是详细的说明: 不能下载的数据: Bulk内的所有数据 通过app开头的数据库链接文件提取的数据(如table-exporter或数据库接口提取的临床表型数据) 可以下载的数据: 通过原始数据分析得到的摘要级数据,例如cox回归结果和基...