UKB目前与AMS和DNAnexus合作,建立了云计算平台Research Analysis Platform(简称RAP,地址:https://ukbiobank.dnanexus.com/landing),所有项目申请获批的研究人员都可以直接使用!本次推送介绍如何在RAP系统中创建项目并下载所需变量。 【注意】RAP使用前提:UK Biobank账号申请成功;Proposal申请成功;拥有AMS账号;数据使用费支...
朱晨:【UK Biobank干货】教你如何从RAP云计算平台下载数据63 赞同 · 197 评论文章 1、登录RAP系统,进入目标Project,点击进入Bulk文件夹,可以看到Brain MRI、Heart MRI、Whole Body DXA等影像数据均存放于此。 2、本教程以提取Brain MRI影像数据为例,依次点击Brain MRI--->dMRI,可以看到许多以数字命名的子文件夹...
variants.tsv.bgz这个文件就在Manifest 201807的第11行,找到下载链接直接下载即可: 下载好之后我们把它读取进来: variants_anno <- vroom::vroom("./ukbiobank/variants.tsv.bgz") dim(variants_anno) ## [1] 13791467 25 发现这个数据和fat_bothsex这个数据的行数是一样的。其实在README的描述中人家就说的很...
创建RAP账号 访问ukbiobank.dnanexus.com/...网址，创建新账户，并将UKB中的AMS账号关联起来。登录RAP系统 使用账户进行登录。建立项目 在RAP系统中，点击PROJECTS选项卡，选择右上角的+ New Project按钮。填写项目名称（如使用"demo1"），申请ID、账单信息等信息，然后点击Create Project创建项目。在创建...
英国生物银行（UK Biobank）已发布了超过60000人的影像数据。本文介绍从Research Analysis Platform（RAP）系统直接下载原始影像数据的方法，适用于具备UKB Tier 3数据权限的用户。使用前提包括UK Biobank账号申请成功、Proposal申请成功、拥有AMS账号、数据使用费支付成功以及数据使用协议签署成功。注意：UKB影像...
UKBiobank RAP 官方平台使用教程更新医工科研团队独家讲授 01 UKB 官方 RAP 平台 table - expoxter 数据提取下载教程 02 RAP 中使用云 RStudio 03 RAP 云 RStudio 工作区备 - 医工科研-孟德尔随机化于20241031发布在抖音,已经收获了1个喜欢,来抖音,记录美好生活!
使用医工科研团队的UAP工具直连RAP平台,让您快速,简单,高效下载数据!无需使用RAP平台进行繁琐的操作下载,利用UAP平台中文界面可进行简单交互式操作,快速高效下载数据!提供单选、多选、全选、自定义指定数据,下载速度最高可达1000M/S。同时提供10PB(1PB=1000TB)的
手把手教你下载UK biobank的GWAS数据SCI狂人团队 2023-09-21 发表于广东 该网站使用了框架技术,但是您的浏览器不支持框架,请升级您的浏览器以便正常访问。本站是提供个人知识管理的网络存储空间,所有内容均由用户发布,不代表本站观点。请注意甄别内容中的联系方式、诱导购买等信息,谨防诈骗。如发现有害或侵权内容,...
UKBiobank数据,能下哪些? 在使用UKBiobank数据时,有些数据是可以下载的,而有些数据则不能下载。以下是详细的说明: 不能下载的数据: Bulk内的所有数据 通过app开头的数据库链接文件提取的数据(如table-exporter或数据库接口提取的临床表型数据) 可以下载的数据: 通过原始数据分析得到的摘要级数据,例如cox回归结果和基...
UK Biobank强制培训三视频课程回顾-RAP平台的数据构造与基本使用教程 医工科研UKB孟德尔 785 0 01:56 UK Biobank的官方RAP平台对接工具来啦!UAP工具助力高效自由下载数据,为您的UKB数据库分析插上翅膀! 医工科研UKB孟德尔 1900 1 05:16 UKB-RAP平台积分计划!从此使用RAP平台分析UKB数据不用花钱啦! 医工科研...