如果你的UK Biobank项目申请Proposal已经成功获批,那么接下来就进入到了数据下载和使用阶段。UKB目前与AMS和DNAnexus合作,建立了 云计算平台Research Analysis Platform(简称RAP,地址:https://ukbiobank.dnan…
朱晨:【UK Biobank干货】教你如何从RAP云计算平台下载数据64 赞同 · 199 评论文章 1、登录RAP系统,进入目标Project,点击进入Bulk文件夹,可以看到Brain MRI、Heart MRI、Whole Body DXA等影像数据均存放于此。 2、本教程以提取Brain MRI影像数据为例,依次点击Brain MRI--->dMRI,可以看到许多以数字命名的子文件夹...
variants.tsv.bgz这个文件就在Manifest 201807的第11行,找到下载链接直接下载即可: 下载好之后我们把它读取进来: variants_anno <- vroom::vroom("./ukbiobank/variants.tsv.bgz") dim(variants_anno) ## [1] 13791467 25 发现这个数据和fat_bothsex这个数据的行数是一样的。其实在README的描述中人家就说的很...
创建RAP账号 访问ukbiobank.dnanexus.com/...网址,创建新账户,并将UKB中的AMS账号关联起来。登录RAP系统 使用账户进行登录。建立项目 在RAP系统中,点击PROJECTS选项卡,选择右上角的+ New Project按钮。填写项目名称(如使用"demo1"),申请ID、账单信息等信息,然后点击Create Project创建项目。在创建...
从此使用RAP平台分析UKB数据不用花钱啦! 669 -- 13:04 App UKBiobank-RAP云RStudio中下载或直接读取工程中的数据 316 -- 3:21 App 3分钟带你认识-PRS多基因评分Polygenic Risk Score 303 -- 2:35 App UKBiobank-RAP-FastUKB可视化工具简介 323 -- 9:03 App UKBiobank-RAP常用直连指令--必备讲解 ...
英国生物银行(UK Biobank)已发布了超过60000人的影像数据。本文介绍从Research Analysis Platform(RAP)系统直接下载原始影像数据的方法,适用于具备UKB Tier 3数据权限的用户。使用前提包括UK Biobank账号申请成功、Proposal申请成功、拥有AMS账号、数据使用费支付成功以及数据使用协议签署成功。注意:UKB影像...
UKBiobank RAP 官方平台使用教程更新医工科研团队独家讲授 01 UKB 官方 RAP 平台 table - expoxter 数据提取下载教程 02 RAP 中使用云 RStudio 03 RAP 云 RStudio 工作区备 - 医工科研-孟德尔随机化于20241031发布在抖音,已经收获了1个喜欢,来抖音,记录美好生活!
手把手教你下载UK biobank的GWAS数据SCI狂人团队 2023-09-21 发表于广东 该网站使用了框架技术,但是您的浏览器不支持框架,请升级您的浏览器以便正常访问。本站是提供个人知识管理的网络存储空间,所有内容均由用户发布,不代表本站观点。请注意甄别内容中的联系方式、诱导购买等信息,谨防诈骗。如发现有害或侵权内容,...
UK Biobank强制培训三视频课程回顾-RAP平台的数据构造与基本使用教程 476 -- 2:24 App 什么是英国生物银行UK Biobank?What is UK Biobank? 3773 -- 11:01 App UK Biobank必学!RAP平台下载UKB数据!独家视频,省钱必看! 825 -- 2:39 App 83个UKB大脑MRI形态数据!云上GWAS数据上新! 566 1 7:52 App RAP中...
UK Biobank(英国生物样本数据库),简称为UKB,UKB生物数据库是由维康信托基金和英国政府(医学研究委员会、卫生部和苏格兰行政院)资助,并注册成为一家慈善公司。该生物数据库是一个试点项目,目的是将英国电子医疗记录中的数据与遗传数据联系起来,从而建立一个更全的英...