长这样: UK biobank的二分类GWAS数据(即疾病)点击链接即可,打开后长这样: 具体的数据可视化及下载链接点这里即可。 进入后点击进入到具体的表型。 共有1419个二分类表型数据,点击即可下载。 我也整理了批量下载1419个数据的完整下载链接,更多详细信息请点击:Lee Lab处理的UK biobank的疾病性状GWAS数据批量下载...
研究剂量依赖性与疾病风险的关联确实是一个好思路,值得借鉴哦~~该研究采用了UKBB数据库数据,从UKBB数据库和GLGC数据库的GWAS数据中提取了3个作为暴露的遗传因子,并生成了遗传风险评分。先后进行了线性和非线性MR分析。采用比率法计算线性MR估计值,使用逻辑回归和Cox比例风险回归获得了暴露与主要结果的关联。应用分数阶...
生信UKbiobank的gwas数据中1:15791:C:T 其中C和T代表什么?1是1号染色体，15791是该染色体第15791位...
Overview of the data QC, code, and GWAS summary output from the 2017 UK Biobank data release - UK_Biobank_GWAS/20.create_finngen_phenotype_summaries.py at master · liameabbott/UK_Biobank_GWAS
With the re-release of UK Biobank genotype imputation (which we term imputed-v3), we have generated an updated set of GWAS summary statistics for the genetics community. Increased the number of phenotypes with application UKB31063 and addtl. custom curated phenotypes (see imputed-v3 Phenotypes)...
vds = vds.filter_samples_table(kt_samples, keep=True) print 'nSamples: {:,}'.format(vds.num_samples) vds = vds.variant_qc() vds = vds.drop_samples() vds.write('gs://ukb31063-mega-gwas/hail-0.1/qc/ukb31063.imputed_v3.variant_qc.autosomes.vds', overwrite=True)©...
手把手教你下载UK biobank的GWAS数据SCI狂人团队 2023-09-21 发表于广东 该网站使用了框架技术,但是您的浏览器不支持框架,请升级您的浏览器以便正常访问。本站是提供个人知识管理的网络存储空间,所有内容均由用户发布,不代表本站观点。请注意甄别内容中的联系方式、诱导购买等信息,谨防诈骗。如发现有害或侵权内容,...
通过重新发布UK Biobank基因型估算(我们称其为impulated-v3),我们为遗传学界生成了一套更新的GWAS摘要统计信息。 应用UKB31063和addtl增加了表型的数量。 自定义策展表型(请参阅估算的v3表型) 更自由地包含样本(请参阅估算的v3样本质量控制) 包含更多SNP(请参阅估算的v3变体质量控制) 更新了我们的关联模型(impte...
.英国生物库演示用户指南:入门 1 简介 英国生物库拥有2006年至2010年间在英国招募的50万40-69岁参与者(男女人数大致相等)的前所未有的数据。展示(可在http://www.ukbiobank.ac.uk)旨在以全面简洁的方式提供可用于健康相关研究的数据,并为考虑申请使用该资源的...
(c) GWAS of hip index calibrated for UK Biobank participants (HIUKB); P-P-values were derived from BOLT-LMM infinitesimal models; SNP-single nucleotide polymorphism; horizontal lines correspond to the genome-wide significance cut-offP = 5*10–8. Genomic risk loci with their corresponding ...