4、抑郁症与其他精神和神经发育障碍之间的罕见变异遗传重叠 为了进一步研究抑郁症与其他精神和神经发育障碍之间的罕见变异遗传重叠,研究者进行了自包含基因集负荷测试,以调查由GWAS或全外显子组测序研究确定的与抑郁症相关的疾病基因中罕见编码变异负荷的影响。抑郁症、精神分裂症或双相情感障碍GWAS基因中的罕见编码变异负...
长这样: UK biobank的二分类GWAS数据(即疾病)点击链接即可,打开后长这样: 具体的数据可视化及下载链接点这里即可。 进入后点击进入到具体的表型。 共有1419个二分类表型数据,点击即可下载。 我也整理了批量下载1419个数据的完整下载链接,更多详细信息请点击:Lee Lab处理的UK biobank的疾病性状GWAS数据批量下载...
研究剂量依赖性与疾病风险的关联确实是一个好思路,值得借鉴哦~~该研究采用了UKBB数据库数据,从UKBB数据库和GLGC数据库的GWAS数据中提取了3个作为暴露的遗传因子,并生成了遗传风险评分。先后进行了线性和非线性MR分析。采用比率法计算线性MR估计值,使用逻辑回归和Cox比例风险回归获得了暴露与主要结果的关联。应用分数阶...
微卫星是人类基因组中突变速度最快的变异之一,也是GWAS中通常被忽视的遗传变异来源。研究发现在XBI队列中,DMPK基因的3 ' UTR内编码DM1蛋白激酶的微卫星与肌强直性营养不良之间的关联:DMPK的表达与微卫星的重复次数呈负相关,肌强直性营养不良的风险随...
然而,GWAS数据所关注的常见变异很多时候并不一定是导致该表型的直接原因,因此,需要进一步的研究来确定哪些基因或生物过程实际上是导致该表型的原因。而大规模人群队列研究在直接识别罕见变异、功能变异等方面更具优势,也能够更高效地评估罕见有害遗传变异的外显率、风险和携带者频率。
Designed using imputation-aware SNP selection, this array provides optimized content modules for genome-wide association studies (GWAS) of common and low-frequency variants, biological function, and human disease in populations of European and British ancestry. The comprehensive coverage also includes ...
2024年,UK Biobank宣布将不再支持影像和基因测序等原始数据的下载,取而代之的是公开影像计算所得的指标(如皮层厚度、皮层面积等)和测序数据计算所得的GWAS summary data。🚫 禁止下载数据的实现方式: 将数据集中放置在一个名为bulk的文件夹中。 阻止数据从该文件夹下载到本地电脑。为了...
.英国生物库演示用户指南:入门 1 简介 英国生物库拥有2006年至2010年间在英国招募的50万40-69岁参与者(男女人数大致相等)的前所未有的数据。展示(可在http://www.ukbiobank.ac.uk)旨在以全面简洁的方式提供可用于健康相关研究的数据,并为考虑申请使用该资源的...
对UK Biobank提供的基因和多模态脑影像数据进行共同分析为我们探究大脑结构和功能的遗传基础提供了前所未有的机会,本研究对3144个影像指标进行了全基因组关联分析(GWAS),这些影像指标包括全脑的多模态信息,如灰质体积、面积、厚度,白质连接以及功能连接等。本研究共利用8428个被试对17734353个SNP和3144个影像指标进行了...
gwaswdlukbiobank UpdatedJul 30, 2024 Jupyter Notebook Python implementation of POPDx - Predictions for unseen, rare, and common labels. deep-learningukbiobankphenotyping-algorithms UpdatedJun 26, 2024 Python Identifying healthy individuals with Alzheimer neuroimaging phenotypes in the UK Biobank ...