Research Analysis Platform(简称RAP,地址:ukbiobank.dnanexus.com/)是UKB与AMS和DNAnexus合作推出的云计算平台,功能强大,是未来数据分析和计算的趋势。 【注意1】UKB影像数据下载使用前提:具备UKB Tier 3数据权限(9000英镑档)。 【注意2】UKB分配给每个所申请项目Project中的eid都是随机生成
英国生物银行(UK Biobank)已发布了超过60000人的影像数据。本文介绍从Research Analysis Platform(RAP)系统直接下载原始影像数据的方法,适用于具备UKB Tier 3数据权限的用户。使用前提包括UK Biobank账号申请成功、Proposal申请成功、拥有AMS账号、数据使用费支付成功以及数据使用协议签署成功。注意:UKB影像数...
如果你的UK Biobank项目申请Proposal已经成功获批,那么接下来就进入到了数据下载和使用阶段。UKB目前与AMS和DNAnexus合作,建立了云计算平台Research Analysis Platform(简称RAP,地址:ukbiobank.dnanexus.com/),所有项目申请获批的研究人员都可以直接使用!本次推送介绍如何在RAP系统中创建项目并下载所需变量。 【注意】RAP...
创建RAP账号 访问ukbiobank.dnanexus.com/...网址,创建新账户,并将UKB中的AMS账号关联起来。登录RAP系统 使用账户进行登录。建立项目 在RAP系统中,点击PROJECTS选项卡,选择右上角的+ New Project按钮。填写项目名称(如使用"demo1"),申请ID、账单信息等信息,然后点击Create Project创建项目。在创建...
The UK Biobank RAP, enabled by DNAnexus, is an all-in-one platform: secure, compliant cloud infrastructure + tools + UK Biobank dataUK Biobank is a large-scale biomedical database and research resource, containing in-depth genetic and health information from half a million UK participants, ...
今天我们来聊聊UKBiobank的RAP平台,这可是医工科研人员的好帮手哦!😎 UKBiobank RAP 平台数据提取与下载教程 📊 首先,咱们得学会怎么从RAP平台提取数据。UKBiobank的数据资源丰富,但如何高效提取呢?这里有详细的教程,教你如何快速下载你需要的数据。 云RStudio的使用技巧 🌐 接下来,我们聊聊云RStudio。在RAP平台...
换句话说,只有呈现在文章中的数据图表才可以下载,而涉及到UKBiobank原始数据的都不允许下载!不能下载是指不允许下载到自己的电脑里,但可以下载到RAP上提供的云分析工具(如jupyterlab、云RStudio等)中进行分析。 需要注意的是,有些同学误以为table-exporter提取出来的数据可以下载,但实际上这些数据属于原始数据,是不允...
UK Biobank宣布自2024年6月14日起,其数据只能通过Research Analysis Platform (RAP)云端平台获取。这一变更在UK Biobank的全球研究用户群中引起了震动,与此前预期一致。UKB团队的Huma Baig在官方论坛上对此进行了说明,并关闭了评论功能。研究人员面临两个主要挑战:首先,从本地数据处理和计算方式转向使用...
第一节PRS多基因评分理论基础第二节 UKBiobank数据库的l 医工科研-孟德尔HZ 21 0 500英镑成功申请UKB数据#ukbiobank #ukb #学生申请UKB #ukbiobank#SCI #医学生笔记 医工科研-孟德尔HZ 62 0 RAP平台花费详细说明!UKB数据库的RAP平台积分如何申请? 医工科研-孟德尔HZ 101 0 RAP平台做UKB数据的PRS分析!系统...
UK Biobank在不久之前(2024年6月14日)突然暂停了AMS中的数据下载系统,当时未对具体原因和细节说明。 与博主之前预料的情况一致,UK Biobank Community今天宣布: UKB数据现在只能够通过RAP云端平台获取(“UK B…