Bulk内的所有数据 通过app开头的数据库链接文件提取的数据(如table-exporter或数据库接口提取的临床表型数据) 可以下载的数据: 通过原始数据分析得到的摘要级数据,例如cox回归结果和基线表统计结果 对统计结果进行画图产生的图表数据 换句话说,只有呈现在文章中的数据图表才可以下载,而涉及到UKBiobank原始数据的都不允许...
【注意3】大宗影像数据的Bulk下载方法需要用到申请成功邮件里的MD5和ukbfetch等工具,网上已有教程请自行搜索。 【注意4】RAP使用前提:UK Biobank账号申请成功;Proposal申请成功;拥有AMS账号;数据使用费支付成功;数据使用协议签署成功。 【注意5】RAP有数据存储和使用费,但UKB直接release的raw data存储不收取费用,具体价格...
【注意3】基因数据等特殊类型数据在RAP中属于Bulk Data,不在本教程讨论范畴中。 1、注册RAP账号 打开ukbiobank.dnanexus.com/ 网站,新建账号(CREATE AN ACCOUNT)并关联UKB中的AMS账号。 2、登录RAP系统 注册成功后,每次使用选择LOG IN选项以登录RAP系统。 3、创建项目(Creating a Project) 进入RAP系统后,在PROJEC...
如果PubMed、UK Biobank、TCGA 等数据库被禁用,中美科技脱钩,国内科研要被卡脖子了吗? 中美科技战终于打到了生物、医学领域。 2月28日,美国白宫发布消息称,拜登正式签署了《关于防止关注国家获取美国公民大量敏感个人数据和美国政府相关数据的行政命令》(Executive Order on Preventing Access to Americans’Bulk Sensiti...
explore-ukb-data.Rmd + + + + + + The UK Biobank is a resource that includes detailed health-related and genetic data on about 500,000 individuals and is available to the research community. ukbtools removes all the upfront data wrangling required to get a single dataset for statistical ...
在RAP系统中，用户需登录并进入目标Project，找到Bulk文件夹，按照Brain MRI、Heart MRI、Whole Body DXA等类别查找数据。以提取Brain MRI影像数据为例，用户需进入dMRI子文件夹，文件命名格式为7位数字_5位数字_1位数字_1位数字，其中7位数字代表个体的eid，5位数字是Data Field ID。用户随意选择一个...
如果PubMed、UK Biobank、TCGA 等数据库被禁用,中美科技脱钩,国内科研要被卡脖子了吗? 中美科技战终于打到了生物、医学领域。 2月28日,美国白宫发布消息称,拜登正式签署了《关于防止关注国家获取美国公民大量敏感个人数据和美国政府相关...
2月28日,美国白宫发布消息称,拜登正式签署了《关于防止关注国家获取美国公民大量敏感个人数据和美国政府相关数据的行政命令》(Executive Order on Preventing Access to Americans’Bulk Sensitive Personal Data and United States Government-Related Data by Countries of Concern),限制包括中国在内的国家科研人员访问和使...
「如果PubMed、UK Biobank、TCGA 等数据库被禁用」中美科技脱钩,国内生物科研要被卡脖子了吗? 中美科技战终于打到了生物领域。 2月28日,美国白宫发布消息称,拜登正式签署了《关于防止关注国家获取美国公民大量敏感个人数据和美国政府相关数据的行政命令》(Executive Order on Preventing Access to Americans’Bulk ...
ukbm is a collection of code for facillitating data management of the UK Biobank bulk data. The code allows users to manage downloads by splitting by modality, limiting downloads to new data, and parallelize fetching. Data structure conversion to BIDS is supported for NIFTI data (e.g. T1...