相比早期和中期,BCLC_C期外周血T细胞的TCR克隆性显著增加,多样性显著减少,提示PBMC比肿瘤组织能更好地描绘HCC患者不同肿瘤分期的TCR特征。我们明确了HCC患者TCR与预后的关系,患者TCR克隆性较高,肿瘤复发风险较低,预后较好。我们推测早期组织...
相比早期和中期,BCLC_C期外周血T细胞的TCR克隆性显著增加,多样性显著减少,提示PBMC比肿瘤组织能更好地描绘HCC患者不同肿瘤分期的TCR特征。我们明确了HCC患者TCR与预后的关系,患者TCR克隆性较高,肿瘤复发风险较低,预后较好。我们推测早期组织中TCR的克隆性可成为预测患者术后复发的重要指标。 研究者说 解析不同...
单细胞TCR全谱分析方法主要采用两种策略:从单细胞cDNA开始直接目标扩增和测序,或从单细胞RNA-seq数据重建TCR。 2)Single Cell TCR Enrichment and Sequencing TCR的富集及测序 第一次尝试测序单细胞TCRα和β链使用与Sanger测序或高通量测序相关的多重PCR策略。Hans和他的同事们用多重PCR方法对浸润人结肠癌的T淋巴细...
T细胞介导的抗原识别取决于T细胞受体(TCR)与抗原主要组织相容性复合体(MHC)分子的相互作用。所有T细胞的TCR总和称为TCR库(TCR repertoire),每个人的TCR库是高度多样化的,这种多样化有利于识别更多的外源抗原,但同时也对利用传统方法鉴定TCR库构成了挑战,因此,亟需...
1 T细胞受体(T cell receptor,TCR)是T细胞表面特异性识别抗原和介导免疫应答的分子,是人类基因组中多态性最高的区域之一,决定着人的免疫系统如何适应环境的变化。T细胞受体库的多样性(包括基因重组以及选择性表达)直接反映了机体免疫应答的状态。2 TCR可分为TCRα/β和TCRγ/δ两种类型, 外周血T细胞主要为TCRα/...
高通量测序(HTS)技术可以同时对成千上万个T细胞受体的基因序列进行分析。这项技术通过测定TCRβ链或α链基因重排区域的序列,来鉴定T细胞的多样性和特异性。 1)样本准备:从血液、组织或其他免疫细胞富集的样本中提取总RNA或DNA。 2)扩增:使用特异性引物针对TCR基因的多个区域进行PCR扩增,以增加检测的灵敏度和特异性...
TCR是由两条不同肽链构成的异二聚体,由α、β两条肽链组成,每条肽链又可分为可变区(V区),恒定区(C区),跨膜区和胞质区等几部分;其特点是胞质区很短。 在T细胞发育过程中CDR1、2和FR区域相对保守,CDR3区由V、D和J 进行重排而形成具有功能的TCR编码基因(T细胞克隆),由于V(65~100种)、D(2种)、J(13...
T细胞受体(T cell receptor,TCR)是T细胞表面特异性识别抗原和介导免疫应答的分子,是人类基因组中多态性最高的区域之一,决定着人的免疫系统如何适应环境的变化。T细胞受体库的多样性(包括基因重组以及选择性表达)直接反映了机体免疫应答的状态。 T细胞受体测序(TCR seq) ...
T细胞受体测序(TCR seq),采用多重扩增的手段获取TCRβ的CDR3区域,结合高通量测序技术,结合生物信息学分析手段,分析VDJ重排的方式等,广泛应用于肿瘤免疫、自身免疫性疾病、器官移植免疫监测、疫苗注射免疫监测等领域。 技术特点 多重扩增:使用多组PCR引物对TCRβ的CDR3区域进行扩增,而非探针捕获 ...
早期,Yamazaki等发现RT-PCR-SSCP是分析牙周炎T细胞免疫应答、研究疾病发病机制的有力工具,但其仍具有一定的限制性,对牙周炎TCR CDR3谱系的研究较为局限,其详细特征有待进一步阐明。 对T细胞不同亚群的TCR CDR3谱系的进一步深入研究,探讨TCR偏向取用情况,尤其是应用高通量测序技术寻找牙周炎特定T细胞亚群相关CDR3序列...