近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association st…
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心(NGDC)开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research在线发表。 全转录组关联研究(Transcriptome-Wide Association...
作为第一完成人,获国家自然科学奖二等奖及Atlas国际奖,2015年当选中国科学院院士和第十五届亚洲生物物理联盟主席。
Home - TWAS Atlas - CNCB-NGDC 结合这个数据库,目前已经有250多种疾病做完了TWAS分析,可以推测其实TWAS已经发展了很多年了。我们要想自己做分析的话可以先参考这个数据库。 2023年TWAS还能发什么paper? 咨询我TWAS问题的同学,其实最关心的是TWAS还能不能发paper,怎么做,怎么设计实验能发高分paper。 我检索了一下...
队列数据收集自Neale实验室UKBB v3、GeneATLAS和GWASATLAS。尽管这些来源都来自于UKBB，但由于样本选择、质量控制过程和所使用的关联模型类型的不同，它们的摘要统计数据可能会有所不同。非UKBB组群包括GWAS公共数据库的摘要统计数据，如GWAS目录、LDHub、GRASP、PhenoScanner和db-GaP；以及来自联盟网站的摘要统计数据，如...
北京基因组所(国家生物信息中心)发布全转录组关联研究知识库TWAS Atlas 近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中 生物信息 ci 数据库 转载 wx643df9f1afa1d 2023-04-26 10:12:54 31阅读 回归分析聚类分析时间序列分析 模型原理 Xgboost(Extreme Gradient Boost)模型,...
首先QTL是数量性状位点，比如身高是一个数量性状，其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点，而eQTL...
M, Buyamin EV, Sonthalia R, Ando Y, Hatano H, Sonehara K; Asian Immune Diversity Atlas ...
eqtl和qtl都是与表达型状量相关的基因定位标记。其中，eqtl指的是表达性状定量遗传位点，通常是基因特异...
eqtl是体现前面qtl表达程度和方式的基因内含子比较: 将伪bulk内含子与GENCODE (v.32) 比较，发现59....