近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research 在线发表。 全转录组关联研究(Transcriptome-Wide Association Study...
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在国际学术期刊Nucleic A...
转录组广泛关联研究(TWAS)图谱是转录组广泛相关性研究的一个数据库。TWAS Atlas收集了文献报道中基因和性状之间的显著组织特异性关联,并从GTEx数据库中为具有显著SNP基因关联(eQTL)的可用性状构建了转录组水平的知识图谱,实现了多组学水平SNP基因-性状关联的集成和可视化。用户可以轻松的浏览并下载所需信息。 https://...
这类研究显示,通过这种综合分析方法,可以发现许多之前未被报告的与疾病相关的基因和变异。 此外,TWAS研究的一个关键发展是TWAS Atlas数据库的建立,它是一个整合了广泛文献中TWAS发现的知识库。这个数据库收集了来自200篇出版物的401,266个高质量的人类基因-性状关联,涵盖了22,247个基因和257个性状,这为研究者提供了...
发表216篇论文,被他引15,850次,两次入选中国十大科学进展(2007,2012)。作为第一完成人,获国家自然科学奖二等奖及Atlas国际奖,2015年当选中国科学院院士和第十五届亚洲生物物理联盟主席。 来源:TWAS及各高校官网 声明:本文仅作信息传递之目的,仅供参考。本文不对投资及治疗构成任何建议,请谨慎甄别。如涉及作品内容、...
Home - TWAS Atlas - CNCB-NGDC 结合这个数据库,目前已经有250多种疾病做完了TWAS分析,可以推测其实TWAS已经发展了很多年了。我们要想自己做分析的话可以先参考这个数据库。 2023年TWAS还能发什么paper? 咨询我TWAS问题的同学,其实最关心的是TWAS还能不能发paper,怎么做,怎么设计实验能发高分paper。
发表216篇论文,被他引15,850次,两次入选中国十大科学进展(2007,2012)。作为第一完成人,获国家自然科学奖二等奖及Atlas国际奖,2015年当选中国科学院院士和第十五届亚洲生物物理联盟主席。
队列数据收集自Neale实验室UKBB v3、GeneATLAS和GWASATLAS。尽管这些来源都来自于UKBB，但由于样本选择、质量控制过程和所使用的关联模型类型的不同，它们的摘要统计数据可能会有所不同。非UKBB组群包括GWAS公共数据库的摘要统计数据，如GWAS目录、LDHub、GRASP、PhenoScanner和db-GaP；以及来自联盟网站的摘要统计数据，如...
队列数据收集自Neale实验室UKBB v3、GeneATLAS和GWASATLAS。尽管这些来源都来自于UKBB,但由于样本选择、质量控制过程和所使用的关联模型类型的不同,它们的摘要统计数据可能会有所不同。非UKBB组群包括GWAS公共数据库的摘要统计数据,如GWAS目录、LDHub、GRASP、PhenoScanner和db-GaP;以及来自联盟网站的摘要统计数据,如PGC...
The GTEx Consortium atlas of genetic regulatory effects across human tissues Science, 369 (2020), pp. 1318-1330 Google Scholar Gudbjartsson et al., 2008 D.F. Gudbjartsson, G.B. Walters, G. Thorleifsson, H. Stefansson, B.V. Halldorsson, P. Zusmanovich, P. Sulem, S. Thorlacius, ...