近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在国际学术期刊Nucleic ...
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association st…
Home - TWAS Atlas - CNCB-NGDC 结合这个数据库,目前已经有250多种疾病做完了TWAS分析,可以推测其实TWAS已经发展了很多年了。我们要想自己做分析的话可以先参考这个数据库。 2023年TWAS还能发什么paper? 咨询我TWAS问题的同学,其实最关心的是TWAS还能不能发paper,怎么做,怎么设计实验能发高分paper。 我检索了一下...
队列数据收集自Neale实验室UKBB v3、GeneATLAS和GWASATLAS。尽管这些来源都来自于UKBB，但由于样本选择、质量控制过程和所使用的关联模型类型的不同，它们的摘要统计数据可能会有所不同。非UKBB组群包括GWAS公共数据库的摘要统计数据，如GWAS目录、LDHub、GRASP、PhenoScanner和db-GaP；以及来自联盟网站的摘要统计数据，如...
TWAS方法用于分析与疾病或者特定性状想关联的基因表达,TWAS hub利用该方法分析了数百个复杂性状,并将分析结果做成了数据库,方便检索和查看,数据库网址如下http://twas-hub.org/该数据库使用了FUSION这款软件进行TWAS分析,相关结果通过以下两种方式查看1. TRAITS以性状为单位进行查看, 点击右上角的...
此外,TWAS研究的一个关键发展是TWAS Atlas数据库的建立,它是一个整合了广泛文献中TWAS发现的知识库。这个数据库收集了来自200篇出版物的401,266个高质量的人类基因-性状关联,涵盖了22,247个基因和257个性状,这为研究者提供了一个强大的资源来探索基因和性状之间的复杂关系 ...
根据所调查的队列是来自UKBB还是非UKBB,收集了两类公开可用的GWAS摘要统计数据。队列数据收集自Neale实验室UKBB v3、GeneATLAS和GWASATLAS。尽管这些来源都来自于UKBB,但由于样本选择、质量控制过程和所使用的关联模型类型的不同,它们的摘要统计数据可能会有所不同。非UKBB组群包括GWAS公共数据库的摘要统计数据,如GWAS...
TWAS使用公开的基因表达谱数据库，计算表型与特定基因表达谱之间的相关性，以寻找可能与表型相关的基因。...
M, Buyamin EV, Sonthalia R, Ando Y, Hatano H, Sonehara K; Asian Immune Diversity Atlas ...
队列数据收集自Neale实验室UKBB v3、GeneATLAS和GWASATLAS。尽管这些来源都来自于UKBB,但由于样本选择、质量控制过程和所使用的关联模型类型的不同,它们的摘要统计数据可能会有所不同。非UKBB组群包括GWAS公共数据库的摘要统计数据,如GWAS目录、LDHub、GRASP、PhenoScanner和db-GaP;以及来自联盟网站的摘要统计数据,如PGC...