allSignal<-regionPlot(bamFile=sortedBAM,testRanges=tssLocations) 一个有用的功能是我们可以使用 minFragmentLength 和 maxFragmentLength 参数指定要在我们的绘图中使用的配对读取的最小和最大片段长度。这使我们能够仅选择我们的核小体自由信号(< 100 个碱基对)来生成我们在 TSS 区域的图。 代码语言:javascript ...
#形成矩阵文件computeMatrixreference-point --referencePoint TSS -p 15 -b 10000 -a 10000 -R gene.bed -S *.bw --skipZeros -o matrix_test_TSS.gz --outFileSortedRegions regions_test_genes.bed #绘制TSS富集图 plotHeatmap -m matrix_test_TSS.gz -out test_Heatmap.png # reference-point # 选...
CAGE-seq (Cap Analysis of Gene Expression AND deep Sequencing) 可以对mRNA中所有的TSS进行鉴定,这是通过加帽位点鉴定实现的(我更喜欢叫他“绿帽鉴定器”,咳咳)。 什么是加帽? 在细胞核内的转录中,mRNA需要经历多种加工和修饰,包括剪接,5'端的加帽和3'端的加尾,以及碱基上的化学修饰等,才能变为成熟的mRNA...
Five-prime single-cell RNA-seq (scRNA-seq) has been widely employed to profile cellular transcriptomes, however, its power of analysing transcription start sites (TSS) has not been fully utilised. Here, we present a computational method suite, CamoTSS, to precisely identify TSS and quantify its...
パナソニックの導電性高分子アルミ固体電解コンデンサ(OS-CON):20SEQP22M+TSSに関する商品情報、ドキュメントをご紹介いたします。
パナソニックの32SEQP6R8M+TSS : CADデータに関する商品情報、ドキュメントをご紹介いたします。
python TSScall.py [OPTIONS] FORWARD_BEDGRAPH REVERSE_BEDGRAPH CHROMOSOME_SIZES OUTPUT_FILE FORWARD_BEDGRAPHandREVERSE_BEDGRAPHare bedGraph files describing the coverage of 5' ends from Start-seq reads at single-nucleotide resolution. Stranded information is required.FORWARD_BEDGRAPHandREVERSE_BEDGRAPHdescribe...
起订数 100个起批 1000个起批 10000个起批 发货地 广东深圳 商品类型 电子元器件 、 电容器 、 其他类型电容器 商品关键词 20SEQP22M+TSS、 PANASONIC、 C6 商品图片 商品参数 品牌: PANASONIC 封装: C6 批号: 22+ 数量: 36000 RoHS: 是 产品种类: 电子元器件 最小工作温度: -50C 最大...
>>> p = HTSeq.GenomicPosition( "1", 145439814, "+" ) This is really one of the TSSs in the set: >>> pintsspos True We can get a window centered on this TSS by just subtracting and adding a fixed value (half of the desired window size, let's use 3 kb): ...
制造商编号 10SEQP56M+TSS 制造商 Panasonic(松下) 授权代理品牌 唯样编号 A-10SEQP56M+TSS 供货 自营 无铅情况/RoHs 无铅/符合RoHs 描述 6.3*6.0mm -55℃~125℃ ±20% 1000h(125℃) 10V 56uF 2.5mm 聚合物分享: 数据手册 发送到邮箱 PDF资料下载 AAB8000C254.pdf 参数信息 常见问题 参数...