确定全序列完整的情况下,如果只是没有预测出二级结构的话,可以考虑用在线的mitos再注释下,这个也可以预测二级结构,或者根据同属的近缘物种,手动画trna二级结构,一般密码子是固定的,茎环之间的碱基配对也相对较保守,手动也是可以画出来二级结构的。但如果连这个trna序列都还没有注释出来的话,需要先注释找到这个基因,可以用mitos
庐州月光 tRNAdb 收录了来自104个物种的623条tRNA 序列,从数据库中下载对应物种的tRNA 序列和二级结构,以人为例 打开下面的链接 http://trna.bioinf.uni-leipzig.de/DataOutput/Search, 物种输入为 human , 然后点击 search database 数据框 在检索结果页面的底部,可以下载对应的tRNA序列和二级结构 选择Doload FAS...
貂熊线粒体tRNA基因序列及其二级结构预测
tRNAscan预测不出来的tRNA，文献都说比对其他物种，但是比对其他物种只能确定大概的范围吧，没法精确到哪个...
trna二级结构预测 trna二级结构的预测可使用RNA Structure的预测服务器http://rna.urmc.rochester.edu/RNAstructureWeb/index.html。已知trna的数据下载可进入gtrnadb数据库网站http://gtrnadb.ucsc.edu/下载相关序列。 例:预测爬行动物北美绿色安乐蜥的tRNA trna166-ArgTCG 的序列的二级结构...