trna二级结构的预测可使用RNA Structure的预测服务器http://rna.urmc.rochester.edu/RNAstructureWeb/index.html。已知trna的数据下载可进入gtrnadb数据库网站http://gtrnadb.ucsc.edu/下载相关序列。 例:预测爬行动物北美绿色安乐蜥的tRNA trna166-ArgTCG 的序列的二级结构 进入gtrnadb数据库查找trna166-ArgTCG 的...
类似fasta 序列,只不过在序列之后,还有一行信息,描述了RNA的二级结构; 利用http://rna.tbi.univie.ac.at/forna/在线工具对tRNA的二级结构进行可视化 点击左上角的Add Molecule 下拉菜单,选择Add Sequence and Secondary Structure 选项 在弹出的对话框中,输入对应的序列和二级结构信息 点击Submit 按钮,就会生成如下所...
貂熊线粒体tRNA基因序列r及其二级结构预测 张士芳;魏丹;郭媛;朱世兵;李海军 【摘要】貂熊属环北型动物,列入国家Ⅰ级重点保护动物.本文利用PCR扩增、 测序和拼接获得了貂熊线粒体基因组全序列,其基因组全长16575bp,包括13种蛋白质,22种tRNA和2种rRNA和1个控制区.通过软件t RNAScan-SE1-21和RNA structure5.6对...