转座子(transposon,Tn)是存在于染色体DNA上可自主复制和位移的基本单位,在细菌的染色体、质粒或噬菌体之间可以自行移动,通过切割、整合等过程从基因组的一个位置“跳跃”至另一位置。当转座子插入某段基因时,该基因的功能将被破坏,基于这样的特点,转座子经常被用于插入突变的实验中。转座子测序(transposon sequencing...
转座子插入突变结合高通量测序技术(Transposon insertion sequencing, Tn-Seq)是一种新型的研究基因型和表型关系的方法。该方法先建立饱和的转座子突变株文库,再将整个文库在不同的环境下生长。然后提取整个文库的 DNA 并扩增所有转座子插入点附近的片段。通过高通量测序对每个基因的插入频率进行分析,从而确定不同基因...
转座子测序(transposon sequencing,Tn-seq)技术结合了转座子插入诱变和二代测序技术,常被用于细菌基因功能的研究。 转座子测序需要构建一个转座子插入文库,其中大多数或所有非必需基因(non-essential genes)都包含插入物,然后在特定的体外或体内(宿主感染)条件下培养。通过测序确定实验的开始和结束时种群中每个突变体...
转座子测序技术（Tn-seq）是一种结合了转座子插入诱变与二代测序技术的高效研究方法，主要用于细菌基因功能的深入探究。此技术的核心是构建转座子插入文库，其中大部分或全部非必需基因（non-essential genes）均携带插入片段。通过特定体外或体内培养，测序确定实验前后种群中突变体的相对频率。从数据中，...
Tn-seq转座子测序技术服务介绍: 对基因功能的了解落后于基因发现阻碍了我们对微生物表型遗传基础的理解。 大规模并行测序与传统的转座子诱变相结合的转座子测序(Tn-seq),可以以高通量的方式鉴定推定的基因功能。 转座子测序需要构建一个转座子插入文库,其中大多数或所有非必需基因(non-essential genes)都包含插入...
Tn-Seq的技术原理是先建立饱和的转座子突变株文库，但无需对文库中的每个突变株进行分离。随后收集不同处理后的突变株文库，提取整个文库的DNA并扩增所有转座子插入点下游的片段。通过高通量测序分析不同处理的突变株文库中每个突变体的相对频率，量化转座子的插入频率，从而确定细菌在正常条件下生长的...
该研究旨在通过转座子测序(Transposon sequencing,Tn-seq)、表面等离子体共振(Surface Plasmon Resonance,SPR)与高效液相色谱-质谱(High Performance Liquid Chromatography-Mass Spectrometry,HPLC-MS)相结合的方法寻找黄单胞菌中潜在的药剂靶...
Tn-Seq筛选出青枯菌在番茄寄主环境中适应所需的基因 转座子插入测序(Transposon insertionsequencing,Tn-seq)是一种高通量遗传筛选技术,结合了转座子高效随机插入的特点及高通量测序高效鉴定转座子插入位点的优点,可高效鉴定细菌在不同环境中的适应性基因。作者首先针对青枯菌GMI1000构建了一个涵盖所有潜在插入位点80.9...
通过插入转座子来构建饱和突变体库,或逐个敲除基因,然后进行低通量表型筛选.这些方法通常耗时长,需要大量的人力和财力,因此成为基因型和表型研究关联的瓶颈.近十年来,转座子诱变技术与高通量测序技术结合,克服了传统功能基因组学的不足.这种方法被称为转座子测序技术(Transposon sequencing technology,Tn-seq),这一...
转座基因俗称跳跃基因，它的发现改变了人们对基因组序列稳定性的认识。理论上的突破也带来了应用上的拓展，科学家们群策群力，将转座子系统开发成基因研究的各种工具，这又反过来促进了遗传学理论的研究。转座子标签(transposon tagging)技术是研究功能基因的有效工具之一。比如模式植物大多都有很好的突变体库，其中玉米...