edgeR::cpm(TMM,log = F) # CPM(Counts of exon model per million mapped reads) 上面两种方法是等价的。 相比于TPM,此方法没有考虑转录本本身长度的影响,所以样本内不同转录本丰度我们是无法比较的(即同一个样本内测序为相同reads数的两个转录本,并不表示丰度一样,因为他们本身的基因长度不一样。理论上...