TIMER:用于肿瘤浸润免疫细胞综合分析的网络服务器 溴新斯的明发表于肿瘤药理学... 生物信息学分享:肿瘤类数据库的认识 掌心医宝发表于生信入门 那么火的肿瘤免疫分析,这个在线数据库就能搞定! 肿瘤与免疫系统的相互作用在肿瘤的发生、发展和治疗中起着至关重要的作用。 细胞溶解性免疫细胞(T/NK细胞)最初的目的是...
前期我们整理了一些基于转录组的样本免疫浸润水平评估工具,大多数情况下,我们的数据筛选都是开始于TCGA数据集,这时候,在线工具Timer就是一个很好的选择。当然,Timer也可以计算自产数据。 免疫浸润 | TIMER 数据库的基础用法mp.weixin.qq.com/s/E7FLfLAfvvPMfEDvZaOWBA Timer已经发布了两个版本,相关的介绍网上...
在数据库中,timer是一种用于跟踪和记录时间的机制。它可以用于各种用途,包括定时任务、性能监控和数据备份等。通过使用timer,数据库可以在指定的时间间隔内执行特定的操作,或者在特定的时间点触发某些事件。 2. 数据库中timer有哪些常见用途? 数据库中的timer可以用于多种用途,下面列举了几个常见的用途: 定时任务:数...
TIMER数据库的基础用法主要包括以下几点：访问与选择版本：TIMER提供了两个版本，用户可以根据需求选择适合的版本。初始版本已支持免疫浸润评估及TCGA数据的综合分析。TIMER 2.0版本在功能上更为全面，增加了Immune Association、Cancer Exploration和Immune Estimation三个模块。基因表达差异分析：通过Diff Exp模块...
如果你还苦于无处下手,那么我今天介绍的数据库你一定要了解一下。今天我们介绍的肿瘤免疫相关的数据库——TIMER2.0。很多人应该知道TIMER数据库,最近他更新了。文章发表在NUCLEIC ACIDS RESEARCH(IF=11.501)上,出版日期2020年7月2日。文章题目为TIMER2.0 for analysis of tumor-infiltrating immune cells。
在数据库中,Timer没有固定的中文全称,但根据其在数据库中的功能,可以将其理解为“定时器”或“时间测量器”。 定时器:指的是数据库中一种自动执行特定任务的设备或程序,它可以在特定时间或经过特定时间间隔后触发执行某些任务,如定期备份数据库、清理日志文件等。 时间测量器:则主要用于监控和测量数据库操作的执行...
Timer数据库提供了两种版本，用于免疫浸润评估与癌症综合分析。Timer具备Diff Exp模块，输入目标基因名，可获取该基因在33种癌症中的表达箱线图。Timer 2.0增加了Immune Association、Cancer Exploration与Immune Estimation模块，其中Cancer Exploration模块中，输入目标基因名，可生成包含基因在33种癌症中表达情况...
网络连接问题、数据库服务器故障、权限设置错误、文件损坏、软件版本不兼容等原因都可能导致TIMER数据库无法打开。网络连接问题是最常见的原因之一,可能由于网络配置错误、网络延迟或中断等原因导致。在这种情况下,检查网络连接是否正常,确保数据库服务器和客户端之间的网络通信畅通。此外,还需检查防火墙和路由器设置,确保...
Timer 2.0通过运算TCGA所有癌症数据，基于多种免疫浸润算法，支持用户输入基因名和免疫细胞类型进行分析，结果支持多种格式下载，提供直观的p值展示和快速检索功能。注意，选择多种免疫细胞类型可能导致结果数量过多，可能无法显示。在本地下载数据重复计算是可行的，支持用户根据需求进行相关性或其他分析。关注...
肿瘤免疫火得飞起,更新后的TIMER 2.0数据库真心好用! 肿瘤微环境中免疫细胞的组成和丰度是影响肿瘤进展和免疫治疗效果的重要因素。由于直接测量方法的局限性,计算算法通常用于从肿瘤转录组图谱推断免疫细胞组成。这些估计的肿瘤免疫浸润人群与… 酸菜发表于解螺旋 免疫浸润 | TIMER 数据库的基础用法 欢迎关注公众号“被...