图7. TF-miRNA-mRNA调控网络。菱形表示miRNA,绿色圆形表示TF,蓝色圆形表示mRNA,箭头表示调控关系,线条表示蛋白质互作。 参考文献 1. Friedman RC, Farh KK, Burge CB, et al. Most mammalian mRNAs are conserved targets of microRNAs. Genome Res. 2009; 19(1)92–105. 2. Bino J, Anton JE, Alexei A...
乳腺癌TF-miRNA-BCCG调控网络 乳腺癌TF-miRNA-BCCG调控网络 研究背景：microRNA Exportin5 •microRNA（简称miRNA)是一类内源的，长度约为21~25nt，与转录后基因沉默相关的非编码小分子RNA。在动物，其主要通过miRNA5’端的2-8nt的种子序列与靶标基因mRNA的3’端非编码区（3’UTR）不完全互补，进而抑制蛋白质...
miRNA - TF - 基因关键调控网络:研究人员构建了关键调控网络,该网络可阐明关键因子对麻黄碱生物碱、黄酮类、单萜类等 SMs 生物合成的调控作用。不同关键调控基因在 ES 或 ER 中的表达偏好影响终产物积累,导致麻黄茎根代谢物组成差异巨大。 研究结论与讨论部分指出,该研究深入探讨了麻黄茎根差异代谢物的动态生物合...
今天想带大家来学习 networkanalyst 这个网站的使用方法,那这个网站可以用来分析TF -gene、 TF 与 miRNA ,gene-miRNA,protein-chemical 等等它们之间的相互作用。 我们还是来先看一下文件里,那这个文件它就是用 networkanalyst分析了 TF -gene以及TF-mRNA,你会发现它这个下面有给到你它的筛选的一个数值是多少。...
3、 limma-voom分析H19高低表达组,鉴定上下调miRNA,TF,gene。 4、 选择符合以下要求(1)H19(↓)——靶miRNA(↑)——靶tf或靶基因(↓);(2)H19(↑)——靶miRNA(↓)——靶tf或靶基因(↑)的三联体进行细胞实验验证。 结果: 1. H19在24种癌症中的表达水平分析 从TCGA中提取24种癌症中lncRNAs、TFs和基因...
TFmiR是一个整合分析TF、miRNA、target genes间互作的免费的web server,这三者都与疾病发病机制相关。细胞内在运作依赖于一个极其复杂的激活抑制系统的正确运作,其可能受许多方式的扰动。TFmiR有助于从网络的分子层面更好的阐述细胞机制。 TFmiR提供拓扑性质及功能的分析,使得其在生命科学领域中对研究者而言成为可信的系...
Erratum: Unraveling novel TF-miRNA regulatory crosstalk in metastasis of Soft Tissue SarcomaMICRORNAMETASTASISSOFT tissue infectionsCancer metastasis is a disease of extreme clinical relevance, as it is responsible for more than 90% of cancer-associated mortality. The molecular mechanism and critical ...
本研究利用基于基因表达数据库(GEO)的GSE148864数据集确定与心肌缺血再灌注损伤(MIRI)相关的重要微RNA(miRNA),并创建与MIRI相关的miRNA‑转录因子(TF)‑信使核糖核酸(mRNA)调控网络,为进一步分析MIRI的分子调控网络和发病机制提供了依据。 ...
TF-miRNA-mRNA-Network 转录因子与miRNA作用网络图 miRNA的转录因子预测 转录因子的靶标预测 转录因子与lncRNA作用网络图 lncRNA的转录因子预测 价格: 在线询价 地址:北京 周期:7个工作日 查看商家电话 服务描述 服务简介 根据差异mRNA、miRNA和lncRNA,通过Tansfac数据库预测其前体的转录因子,并将预测的转录因子与...
网络分析工具networkanalyst能有效分析TF-gene、TF-miRNA、gene-miRNA以及protein-chemical间的相互作用。通过参考文献中的设置参数，你可以定制分析。例如，它在文献中使用的默认值如ENCODE的single<500, score<1。对于大量节点和边的数据，你可以选择最小网络选项或者筛选degree，以突出重要网络部分。完成分析...