目前,TCR-seq已经成为免疫学和临床研究中不可或缺的工具之一,对于免疫疾病治疗和癌症免疫疗法的研究具有重要的意义。 康测科技作为国内最早提供TCR-seq测序服务的供应商之一,凭借基于RNA检测的5’ RACE方法,一方面可以获得全长TCR信息,更重要的是避免了基于DNA检测的V-J引物...
结果表明,本次测试的9种方法中,研究人员注意到有3种TCR-Seq方法表现更好:mPCR-1、RACE-3和RACE-5。 分析不同的TCR-Seq方法的重复性和再现性 研究团队比较了不同TCR-Seq的重复性(即不同样本采用相同方法获得的数据之间的相似性)和再现性(即不同方法获得的数据之间的相似性)。热图的结果表明,RACE-3在TRA和TR...
1.揭示免疫应答机制： T细胞是免疫系统中重要的组成部分，对抗原的识别和应答至关重要。通过TCR-seq技术...
TCR-seq常用于评价各种免疫相关疾病和遗传性突变引起的某个物种所有T细胞或特定T细胞激活介导的细胞免疫反应中TCR基因重排碱基序列,以及各序列的丰度,用于研究不同T细胞克隆的转录情况和相互间关系,从而揭示更深层次的T细胞功能特异性,继而解释免疫应答机制、免疫耐受原因,免疫调节形式等相关生命现象。在本期推送中,简要介绍...
scTCRseq在肿瘤免疫学中的应用之一是基于T细胞克隆重叠来估计T细胞亚群之间的发育关系。 scTCRseq的另一个应用是鉴定对肿瘤抗原有反应的TCR。肿瘤浸润T细胞不仅包括识别肿瘤抗原的肿瘤反应性T细胞克隆,还包括识别与肿瘤无关的病毒抗原的克隆(63,64)。由于T细胞...
对TCR区域的基本知识分享今天就先到这里吧,不晓得大家是否都get到了TCR到底是什么?下一期小编将就TCR-seq样本、研究目标区域的选择以及几种重要建库方式进行介绍,和大家共同进一步了解TCR-seq,还请期待:干货|TCR-seq知多少(二)! 参考文献: [1] Thomas J. Kindt; Richard A. Goldsby; Barbara Anne Osborne; Jani...
单细胞TCR-Seq技术正好可以为这个问题带来一种完善的解决方案。对单个T细胞进行测序,一方面可以直接获得单细胞水平下克隆型的多样性信息;另一方面也可以直接对α-β链配对信息进行分析研究。为α-β受体链找到失散的“小伙伴”不再那么艰难! 在《50篇20分↑文章,网友:免疫组库分析要火?!》中,我们介绍了“整合了SMA...
不同抗原(肿瘤、疫苗、病院微生物或者移植物等)刺激后，TCR V区基因可对该\抗原产生特异性识别，并使带有这类基因的 T细胞得到优势扩增，可用于分析不同 TCR V亚家族 T细胞的表达和利用。4 T细胞受体测序(TCR seq)，采用多重扩增的手段获取TCRβ的CDR3区域，结合高通量测序技术，结合生物信息学分析手段，分析VDJ...
然后通过TCRβ-seq数据验证了上述假设。分别比较收敛TCRs、克隆扩增TCR和sars-cov-2特异性TCRs的比值比,发现收敛TCRs的比值比几乎一致高于克隆扩增的TCR(图5左)。收敛TCR的平均比值比为8.94,显著高于克隆扩增TCR的比值比1.74(图5右)。这表明TCR收敛是比克隆扩增更好的抗原特异性指标。
单细胞转录组测序(scRNA-seq)是一种在单细胞水平对转录组进行测序分析的高通量测序技术,能够揭示细胞层面的基因表达差异,为研究细胞的异质性提供了有力手段。而TCR/BCR测序是一种用于分析T细胞受体(T cell receptor, TCR)和B细胞受体(B cell receptor, BCR)的高通量测序技术,可以揭示T细胞和B细胞受体的多样性和特...